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模拟失重下小鼠成骨细胞功能相关miRNA生物信息学预测
引用本文:胡泽兵,王冰,曹新生,杜挺媛,张舒. 模拟失重下小鼠成骨细胞功能相关miRNA生物信息学预测[J]. 航天医学与医学工程, 2012, 25(6): 407-411
作者姓名:胡泽兵  王冰  曹新生  杜挺媛  张舒
作者单位:第四军医大学航空航天生物动力学教研室,航空航天医学国家教育部重点实验室,陕西西安710032
基金项目:国家自然科学基金项目(31170889,30870595)
摘    要:目的 应用生物信息学方法预测模拟失重环境下与小鼠成骨细胞功能变化相关的miRNAs.方法 收集并整理已报道的针对模拟失重环境下小鼠成骨细胞内mRNAs表达变化的基因芯片检测数据,分析差异表达显著的mRNAs,搜集其基因组定位信息;在miRBase数据库中查找处于这些基因组位置上的内含子miRNAs,并应用靶基因预测、GO富集分析和KEGG pathway富集分析进行后续miRNA功能预测.结果 鉴定出5种与宿主mRNA共处同一转录单元的潜在内含子miRNAs.结论 预测出的5种内含子miRNAs在模拟失重环境所致成骨细胞功能变化中具有潜在调控作用,为进一步实验研究提供数据支持和理论指导.

关 键 词:模拟失重  生物信息学  microRNAs  成骨细胞

Prediction of Micro-RNA Related to Change of Mouse Osteoblast Function Under Simulated Microgravity with Bioinformatics Method
Hu Zebing,Wang Bing,Cao Xinsheng,Du Tingyuan,Zhang Shu. Prediction of Micro-RNA Related to Change of Mouse Osteoblast Function Under Simulated Microgravity with Bioinformatics Method[J]. Space Medicine & Medical Engineering, 2012, 25(6): 407-411
Authors:Hu Zebing  Wang Bing  Cao Xinsheng  Du Tingyuan  Zhang Shu
Affiliation:.Key Laboratory of Aerospace Medicine,Chinese Ministry of Education,Xi’an Shaanxi 710032,China
Abstract:
Keywords:
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