两种微量DNA提取方法的比较

目的：比较Promega Wizard Genomic DNA纯化试剂盒（PWGDPK）和国产星普液体微量DNA提取试剂盒（SLDPK）提取DNA的效果，探讨从冷冻保存的人外周血中提取基因组DNA的最佳方案。 方法：采用反复冻融3次并在-20℃冻存1年的12例健康成人外周血样品，分别应用两种试剂盒提取基因组DNA，并采用吸收光谱法、琼脂糖凝胶电泳和PCR扩增等方法分别对提取的基因组DNA进行对比鉴定。 结果：PWGDPK提取的DNA浓度为15.0~130.0 mg·L^-1［（74.8±39.3）mg·L ^-1］，而SLDPK为15.5~37.0 mg·L^-1［（26.6±6.2）mg·L ^-1］，前者显著高于后者（t=4.119，df=11，P＜0.005）。但两种试剂盒提取的基因组DNA纯度都不高，大多数样品A₂60/A₂80比值偏离了1.8～2.0范围。PWGDPK提取的12个基因组DNA样品，琼脂糖凝胶电泳后都可见电泳带，9个条带较深，3个条带较浅。SLDPK提取的样品中，只有7个可见较浅的电泳带。应用两种试剂盒提取的12个基因组DNA样品作为模板进行PCR反应后，在rs1171558 SNP位点均有11个样品（91.7%）获得目的片段；在rs2248745 SNP 位点，应用SLDPK只有4个样品（33.3%）获得目的片段，应用PWGDPK有10个样品（83.3%）获得目的片段，后者明显优于前者。 结论：PWGDPK比SLDPK更适合于从长期冷冻保存且反复冻融过的全血中提取基因组DNA。

Comparison between two methods of DNA extraction