| 基于长期研究队列的广西隆安县乙型肝炎病毒准种研究 |
| |
| 作者姓名： | 贾蕙华 陈钦艳 蒋智华 王学燕 张文嘉 TIM J Harrison J BROOKS Jackson LI Wu 方钟燎 |
| |
| 作者单位： | 1. 广西壮族自治区疾病预防控制中心,广西病毒性肝炎防制研究重点实验室;2. 广西医科大学基础医学院;3. Division of Medicine, University College London Medical School;4. Carver College of Medicine, University of Iowa |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（No.81860595）; |
| |
| 摘 要： | 目的 明确广西隆安县队列HBs Ag无症状携带者感染的乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)准种序列长期演化特征。方法 收集9名广西隆安县队列HBs Ag无症状携带者2004年、2007年、2013年、2019年或2020年4个不同时间点血清样本。酶联免疫吸附测定法检测HBV血清学标志物;聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)荧光探针法检测HBV病毒载量;试剂盒提取HBV DNA;PCR法扩增HBV全基因组,进行二代测序;利用Mega等软件对所获得的序列进行生物信息学分析。结果 共获得23份血清样本,309条全长基因准种序列,每份标本平均获得(0.18±0.07)G测序数据量。55.55%(5/9)的研究对象携带的HBV毒株基因型在长期进化过程中发生了基因型转换,Pre S/S区系统进化树基因分型结果与全基因组分析结果完全一致;发现B/C、I/C重组体;各研究标本的Sn值范围为0～0.37,D值范围为0～0.11;共检出21种特殊单核苷酸/氨基酸突变位点(S区7种,X区2种,Pre C区3种,BCP区9种)和6种缺失突变,...
|
| 关 键 词： | 乙型肝炎病毒 基因型 二代测序 准种 基因突变 |
|
|
