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三阴性乳腺癌5基因预后风险评估体系
作者姓名:周英  徐图  史春桃  沈栩  许紫鹏
作者单位:江苏省无锡市锡山人民医院普外科
摘    要:目的:构建适用于三阴性乳腺癌患者的预后评估体系。方法:从TCGA数据库下载三阴性乳腺癌患者的转录组及临床数据。通过R语言包对肿瘤组和正常组中的差异基因进行分析。采用单因素和多因素COX比例风险回归模型对差异基因进行分析,构建预后风险评分体系。ROC曲线用于评估预后风险评分体系的效果。运用GSEA对高风险组和低分险组的差异通路进行分析。结果:共得到三阴性乳腺癌组与癌旁组织中差异表达的m RNA 2249个。通过单因素COX比例风险回归模型得到9个与三阴性乳腺癌患者预后密切相关的基因。结合多因素COX比例风险回归模型得到风险评分,形成一个5基因的风险评估体系(风险评分=0.7305×SLC6A9+0.4763×TSTA3+0.6993×SDS+0.4001×SPTBN2+0.4820×SRPK3)。风险评分是三阴性乳腺癌患者独立的预后指标(HR=10.620,95%CI(2.922~38.595),P<0.001)。ROC结果显示5基因预后风险评估体系具有良好的评估效果(5年AUC=0.807)。GSEA发现多条糖代谢通路在高风险组中被激活。结论:我们构建的5基因预后风险评估体系是三...

关 键 词:三阴性乳腺癌  TCGA  风险评分  预后
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