| 基于HIV-1 pol基因DNA或RNA序列的分子传播网络的配对比较 |
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| 作者姓名： | 陈金 陈欢欢 罗柳红 康瑞华 梁淑家 朱秋映 陆华湘 刘秀 陈怡 冯毅 廖玲洁 邢辉 邵一鸣 蓝光华 林玫 宋畅 阮玉华 李剑军 |
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| 作者单位： | 1. 中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心,传染病预防控制国家重点实验室;2. 广西壮族自治区疾病预防控制中心,广西重大传染病防控与生物安全应急响应重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家科技重大专项（No.2018ZX10715008,No.2018ZX10721102-006-005）;;国家自然科学基金（No.82160636,No.82260670,No.11971479）;;广西自然科学基金项目（No.2020GXNSFAA159020）; |
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| 摘 要： | 目的 了解HIV感染者成对pol区DNA序列和RNA序列构建分子传播网络的差异,为利用DNA序列构建分子传播网络提供科学数据。方法 采集广西柳州2014年本底存活和2015—2018年新报告HIV感染者全血和血浆标本,分别进行DNA和RNA提取、序列扩增和序列测序、序列拼接、序列比对及亚型判定,构建DNA序列和RNA序列分子传播网络,并比较DNA序列构建的分子传播网络和RNA序列构建的分子传播网络的一致性。结果 本研究中2014年本底和2015—2018年新报告HIV感染者共2 983例,其中2014年本底仅有DNA序列2 590例、2014年本底和2015—2018年新报告的成对pol区DNA序列和RNA序列分别为196例和197例。在393例成对pol区DNA序列和RNA序列中,DNA序列和RNA序列的基因亚型一致,成对DNA序列和RNA序列的基因距离比较差异无统计学意义（Z=-2.72,P=1.00）。2015—2018年新报告HIV感染者成对pol区DNA序列和RNA序列与2014年本底DNA序列构建的分子传播网络连接一致性为91.4%(180/197);2015—2018年新...
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| 关 键 词： | 艾滋病病毒 DNA序列 RNA序列 分子传播网络 抗病毒治疗 |
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