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结核病患者免疫相关基因表达变化的基因芯片研究
引用本文:赵雁林,端木宏谨,李亮,宋长兴,赵冰. 结核病患者免疫相关基因表达变化的基因芯片研究[J]. 中华结核和呼吸杂志, 2005, 28(5): 301-304
作者姓名:赵雁林  端木宏谨  李亮  宋长兴  赵冰
作者单位:101149,北京市结核病胸部肿瘤研究所-国家结核病参比实验室
基金项目:北京市科技新星基因资助项目(2004B16)
摘    要:目的 探讨免疫相关基因在结核病患者体内的差异表达。方法 应用基因芯片技术和生物信息学方法,对63例单纯结核性胸膜炎患者胸腔积液及其外周血中单核细胞与69例肺癌患者的癌性胸腔积液和其外周血中单核细胞的mRNA表达水平进行分析比较,所做的表达谱杂交检测均重复1次并在荧光交换后再重复1次以抑制噪声,对阳性和部分阴性结果进行northern blotting复验。结果 在对基因表达谱原始数据进行标准化校正、聚类分析和统计学处理后,发现在626条免疫相关基因中差异表达基因53条,其中与细胞增殖相关的基因16个,与细胞免疫应答相关的基因14个,与信号传导有关的基因20个,其他相关基因3个;在结核病患者胸腔积液淋巴细胞中tnf-A、iglλ、il-17、il-17r、hla-dp、lcp1、tcrA、tcrB、hsp75、cxcr4、fyb、hla-g、hla-a、il18bp、il-2r、il-B、il-8、ip-10、mcp-1、il-12、il-12r、il-10、canx、irf2、ifn-Г、tlr、il-1、il-7、tlr、lsp-1、il-14共31个基因表达较对照组增高4倍以上,il-4、il-18、il-15、ifg-1、scya14、ablim、peci、ppid、hsf2、actg2、maoa、ttid、gatm、tgfb3、insr、thbd、trap1、tcrГ、tcr△、il-13r、il-11、igf1、a2m共22个基因表达水平较对照组降低4倍以上。结论 机体抗结核免疫的发生、发展涉及多基因改变,tnf-A、il-17、il-12、tcrA、tcrB、hsp75、cxcr4以及il-4、il-18、il-15等免疫相关基因差异变化显著,提示其或许可以为结核病临床生物治疗、辅助诊断和患者免疫水平评价提供参考。

关 键 词:结核病患者 基因表达变化 应用基因芯片技术 northern blotting 免疫相关基因 tnf-A il-17 cxcr4 il-12 il-18 il-15 mRNA表达 癌性胸腔积液 结核性胸膜炎 差异表达基因 细胞免疫应答 hla-dp 基因表达水平 单核细胞 il-4
修稿时间:2004-08-18

Study of the expression profile of immunogenesis associated genes in tuberculosis by microarray
ZHAO Yan-lin,DUANMU Hong-jin,LI Liang,SONG Chang-xing,ZHAO Bing. Study of the expression profile of immunogenesis associated genes in tuberculosis by microarray[J]. Chinese journal of tuberculosis and respiratory diseases, 2005, 28(5): 301-304
Authors:ZHAO Yan-lin  DUANMU Hong-jin  LI Liang  SONG Chang-xing  ZHAO Bing
Affiliation:National Tuberculosis Reference Laboratory, Beijing Tuberculosis & Thoracic Tumor Research Institute, Beijing 101149, China.
Abstract:
Keywords:Tuberculosis   pleural  Pleural effusion  Oligonucleotide array sequence analysis
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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