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trap基因表达在表皮葡萄球菌生物膜形成及附属基因调节(agr)系统活化中的作用
引用本文:朱于莉,杨晓梅,李娜,江娟,陈洁敏,秦智强,李敏,吕元,魏武,瞿涤. trap基因表达在表皮葡萄球菌生物膜形成及附属基因调节(agr)系统活化中的作用[J]. 复旦学报(医学版), 2006, 33(5): 580-586
作者姓名:朱于莉  杨晓梅  李娜  江娟  陈洁敏  秦智强  李敏  吕元  魏武  瞿涤
作者单位:1. 复旦大学上海医学院教育部/卫生部医学分子病毒学重点实验室,上海,200032
2. 复旦大学蛋白质组学研究中心,上海,200032
3. 复旦大学附属华山医院检验医学中心,上海,200040
4. 上海生物信息技术研究中心,上海,200235
基金项目:国家高技术研究发展计划(863计划);国家重点基础研究发展计划(973计划);国家自然科学基金;上海市科技发展基金;上海市科委资助项目
摘    要:目的研究表皮葡萄球菌trap基因表达与生物膜形成的相关性及其对agr系统的活化作用。方法采用微量板半定量法检测表皮葡萄球菌生物膜表型,二维电泳和高灵敏度的基质辅助激光解吸附飞行时间质谱分析比较表皮葡萄球菌标准株蛋白质表达谱,实时定量逆转录PCR检测trap基因和RNAⅢ的转录水平,CLUSTALX对表皮葡萄球菌trap基因与金黄色葡萄球菌序列进行分析,Mega软件构建进化树。结果比较分析形成生物膜的表皮葡萄球菌ATCC 35984株与不形成生物膜的ATCC 12228株生长中期的蛋白质组,发现ATCC 35984株的TRAP蛋白量明显高于ATCC 12228株。转录水平的检测显示ATCC 12228株和生物膜阳性临床SE1457、SE671株的trap基因均低转录,但RNAⅢ的转录水平未降低。SE1457株agr系统突变后,RNAⅢ的转录明显降低,trap基因的转录无变化。RNAⅢ的转录随细菌生长变化而增加,trap基因转录保持不变。trap序列分析显示其在表皮葡萄球菌与金黄色葡萄球菌中较为保守,但存在明显的进化距离。结论在本论文所研究的表皮葡萄球菌菌株中,trap基因的转录和翻译与细菌生物膜的形成不存在直接的调控相关性;并提示TRAP蛋白不是表皮葡萄球菌agr系统活化所必需的细菌产物;表皮葡萄球菌trap基因序列与金黄色葡萄球菌之间存在差异,可能与其功能差异相关。

关 键 词:表皮葡萄球菌  trap基因  附属基因调节系统  RNAⅢ  生物膜
收稿时间:2006-03-08
修稿时间:2006-03-08

The role of trap expression in biofilm formation and activating agr system in Staphylococcus epidermidis
ZHU Yu-li,YANG Xiao-mei,LI Na,JIANG Juan,CHEN Jie-min,QIN Zhi-qiang,LI Min,Lü Yuan,Wei Wu,QU Di. The role of trap expression in biofilm formation and activating agr system in Staphylococcus epidermidis[J]. Fudan University Journal of Medical Sciences, 2006, 33(5): 580-586
Authors:ZHU Yu-li  YANG Xiao-mei  LI Na  JIANG Juan  CHEN Jie-min  QIN Zhi-qiang  LI Min  Lü Yuan  Wei Wu  QU Di
Abstract:
Keywords:
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