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泛癌中SMYD3的表达与预后及免疫浸润之间的关系
作者姓名:陈浩然  司甜  姜懿珅  王殿恒  周雅博  吕家迪
作者单位:中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院免疫学系医学分子生物学国家重点实验室
基金项目:国家自然科学基金(82003145);
摘    要:目的 研究SMYD3表达在泛癌中的预后价值,分析SMYD3对于肿瘤组织免疫浸润的影响。方法 从TCGA、GTEx、HPA等数据库收集基因表达矩阵以及蛋白质表达等数据。使用Kaplan-Meier算法评价了SMYD3在不同肿瘤中的预后价值。使用ESTIMATE算法和Timer数据库的信息分析SMYD3与免疫浸润的关系。以小鼠黑色素瘤细胞系B16为例,在细胞水平验证SMYD3对抗原提呈基因表达的影响。结果 转录组和蛋白组学数据表明SMYD3在肿瘤组织中表达升高,并且SMYD3的高表达和泛癌的不良预后相关(P<0.05);SMYD3抑制了多种免疫细胞的浸润(P<0.05),敲除Smyd3的B16细胞抗原呈递基因表达水平升高(P<0.05)。结论 Smyd3是一个重要的肿瘤预后相关基因,其通过下调抗原递呈基因的表达,抑制免疫细胞浸润,诱导肿瘤细胞免疫逃逸。

关 键 词:SMYD3  泛癌分析  免疫浸润  免疫逃逸  MHC-Ⅰ类分子
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