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牡蛎和粪便中GⅠ、GⅡ型诺如病毒实时聚合酶链反应检测方法的建立
引用本文:孙亚萍,程民,宋士利,张心会,李蓉. 牡蛎和粪便中GⅠ、GⅡ型诺如病毒实时聚合酶链反应检测方法的建立[J]. 中华流行病学杂志, 2008, 29(6)
作者姓名:孙亚萍  程民  宋士利  张心会  李蓉
作者单位:1. 杭州市余杭区疾病预防控制中心检验科,311100
2. 中国疾病预防控制中心营养与食品安全所, 北京,100050
摘    要:目的 建立适用于牡蛎和粪便中快速、特异、灵敏的GⅠ、GⅡ型诺如病毒(NV)定量分型诊断方法.方法 通过对GⅠ、GⅡ型NV基因组保守序列的比对分析,设计高度特异的引物和探针,建立以TaqMan探针为基础的实时聚合酶链反应方法(TaqMan Real-time RT-PCR).结果 该方法对NV核酸检测高度特异,且GⅠ和GⅡ型之间无交叉反应,最低检出限达102 copies/μl.对90份新鲜牡蛎样品和37份腹泻粪便标本分别用常规RT-PCR和笔者建立的TaqMan Real-time RT-PCR进行NV检测,发现牡蛎样品中后者的检出率明显高于前者,而粪便标本中两者无明显差别.同时对阳性标本的测序分析证实结果准确可靠.结论 研究中建立的TaqMan Real-time RT-PCR方法可用于海产品标本及粪便中NV定量及分型检测,可作为应对NV胃肠炎暴发的有效诊断方法.

关 键 词:实时聚合酶链反应  诺如病毒  基因型

Study on the use of TaqMan Real-time PCR to detect genogroup Ⅰ and Ⅱ norovirus in oysters and patients' stool samples
SUN Ya-ping,CHENG Min,SONG Shi-li,ZHANG Xin-hui,LI Rong. Study on the use of TaqMan Real-time PCR to detect genogroup Ⅰ and Ⅱ norovirus in oysters and patients' stool samples[J]. Chinese Journal of Epidemiology, 2008, 29(6)
Authors:SUN Ya-ping  CHENG Min  SONG Shi-li  ZHANG Xin-hui  LI Rong
Abstract:
Keywords:Real-time PCR  Norovirus  Genogroup
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