| 反向斑点杂交技术检测HBV基因型方法的评价 |
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| 引用本文： | 张韧,王敏,符瑞佳,李娟,陈建平,何蕴韶. 反向斑点杂交技术检测HBV基因型方法的评价[J]. 上海医学检验杂志, 2010, 0(12) |
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| 作者姓名： | 张韧 王敏 符瑞佳 李娟 陈建平 何蕴韶 |
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| 作者单位： | 广州中医药大学微生物与寄生虫教研室;广州市荔湾区疾病预防控制中心;中山大学达安基因诊断中心; |
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| 基金项目： | 广州中医药大学创新基金资助项目(09CX007); 广东高校优秀青年创新人才培育项目[粤财教(2009)400号] |
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| 摘 要： | 目的评价用于检测乙型肝炎病毒(HBV)基因型的反向斑点杂交(RDB)方法。方法应用RDB检测723例HBV阳性标本的HBV基因型。其中对423例HBV序列测序结果清晰可读的样本进一步使用NCBI在线数据库分析、系统进化法分析其HBV基因型,并与RDB法结果进行比较。将样本HBV序列与所用的探针序列进行比对,以评价单个碱基突变对该方法的影响。结果 RDB法检测的检出率为97.6%。RDB检测结果与NCBI在线数据库分析法的一致性为98.8%;与系统进化分析法一致性为100%。与对应探针有1个碱基差异的HBV A型1例、B型12例、C型46例和D型1例均被成功检出。结论 RDB是一种灵敏、准确、有效,且具有很高临床应用价值的HBV基因型检测方法。单碱基的突变不会影响其对HBV的分型结果。
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| 关 键 词： | 乙型肝炎病毒 基因型 反向斑点杂交 |
Evaluation of reverse dot blot assay for Hepatitis B virus genotyping |
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| ZHANG Ren,WANG Min,FU Ruijia,LI Juan,CHEN Jianping,HE Yunshao.. Evaluation of reverse dot blot assay for Hepatitis B virus genotyping[J]. Shanghai Journal of Medical Laboratory Sciences, 2010, 0(12) |
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| Authors: | ZHANG Ren WANG Min FU Ruijia LI Juan CHEN Jianping HE Yunshao. |
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| Affiliation: | ZHANG Ren1,WANG Min2,FU Ruijia3,LI Juan3,CHEN Jianping3,HE Yunshao3.(1.Department of Microbiology and Parasitology,Guangzhou University of Chinese Medicine,Guangdong Guangzhou 510006,China,2.Guangzhou Liwan Center for Disease Control and Prevention,Guangdong Guangzhou 510176,3.Daan Gene Diagnostic Center of Sun Yat-Sen University,Guangdong Guangzhou 510080,China) |
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| Abstract: | Objective To evaluate the reverse dot blot(RDB) assay for Hepatitis B virus(HBV) genotyping.Methods The HBV genotyping in 723 HBV samples was determined by RDB assay.423 samples of clear sequencing result were further analyzed by National Center for Biotechnology Information(NCBI) online database,and the HBV genotyping was analyzed systematically.The results were compared with those by RDB.The influence of single-nucleotide mutation on RDB was evaluated,and the HBV sequences were compared with probe sequenc... |
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| Keywords: | Hepatitis B virus Genotype Reverse dot blot |
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