| 三七3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶基因的克隆和生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 张萍,刘迪秋,葛锋,赵恒伟. 三七3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶基因的克隆和生物信息学分析[J]. 中草药, 2014, 45(18): 2684-2690 |
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| 作者姓名： | 张萍 刘迪秋 葛锋 赵恒伟 |
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| 作者单位： | 昆明理工大学生命科学与技术学院, 云南 昆明 650500;昆明理工大学生命科学与技术学院, 云南 昆明 650500;昆明理工大学生命科学与技术学院, 云南 昆明 650500;昆明理工大学生命科学与技术学院, 云南 昆明 650500 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目（31260070，31060044） |
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| 摘 要： | 目的克隆三七总皂苷甲羟戊酸合成途径中的1个关键酶3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶(3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme-A reductase,HMGR)基因,为进一步研究HMGR蛋白的功能及开展三七皂苷的合成生物学研究奠定基础。方法根据NCBI上已公布的同属人参的HMGR基因全长序列(登录号GU565097.1)设计特异性引物。利用RT-PCR技术,以三七愈伤组织总RNA反转录的cDNA为模板扩增基因片段;并对其编码的蛋白进行生物信息学预测和基因表达分析。结果序列分析表明,获得的三七HMGR(命名为PnHMGR)基因的cDNA序列大小为1 893 bp,该序列与人参、刺五加和杜仲中HMGR基因的一致性分别达到98%、93%、80%,且含有大小为1 725 bp的开放阅读框,经Genbank查询为一新的cDNA。生物信息学预测PnHMGR基因编码蛋白包含2个跨膜区,不含信号肽,具有HMGR催化作用的活性中心结构域。实时荧光定量PCR检测到PnHMGR基因在三七细胞生长30 d表达量最高。结论首次从药用植物三七中克隆得到HMGR基因的编码区序列,为进一步鉴定PnHMGR的功能和开展三七皂苷的合成生物学研究奠定了基础。
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| 关 键 词： | 三七 三七总皂苷 3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶(HMGR) 基因克隆 生物信息学 |
| 收稿时间： | 2014-03-24 |
Cloning and bioinformatic analysis of 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme-A reductase gene from Panax notoginseng |
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| ZHANG Ping,LIU Di-qiu,GE Feng and ZHAO Heng-wei. Cloning and bioinformatic analysis of 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme-A reductase gene from Panax notoginseng[J]. Chinese Traditional and Herbal Drugs, 2014, 45(18): 2684-2690 |
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| Authors: | ZHANG Ping LIU Di-qiu GE Feng ZHAO Heng-wei |
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| Affiliation: | Faculty of Life Science and Technology, Kunming University of Science and Technology, Kunming 650500, China;Faculty of Life Science and Technology, Kunming University of Science and Technology, Kunming 650500, China;Faculty of Life Science and Technology, Kunming University of Science and Technology, Kunming 650500, China;Faculty of Life Science and Technology, Kunming University of Science and Technology, Kunming 650500, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Panax notoginseng (Burk) F. H. Chen P. notoginseng saponins 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme-A reductase (HMGR) gene cloning bioinformatics |
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