| 基于生物信息学筛选与宫颈癌免疫相关的分子标志物 |
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| 引用本文： | 罗永金,胡晓霞,王 丹,刘 珍,张 侃,洪翠萍.基于生物信息学筛选与宫颈癌免疫相关的分子标志物[J].中国临床新医学,2022,15(4):325-331. |
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| 作者姓名： | 罗永金 胡晓霞 王 丹 刘 珍 张 侃 洪翠萍 |
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| 作者单位： | 530021 南宁，广西壮族自治区人民医院妇科（罗永金，胡晓霞，刘 珍，张 侃，洪翠萍），神经内科（王 丹） |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目（编号：81660434）；广西自然科学基金项目（编号：2018GXNSFAA050098）；广西壮族自治区人民医院青年基金项目（编号：QN2018-6） |
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| 摘 要： | 目的 基于生物信息学方法筛选与宫颈癌免疫相关的分子标志物。方法 从基因表达汇编(GEO数据库获取24例正常宫颈组织和28例宫颈癌组织数据。从癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取306例宫颈癌组织和3例正常宫颈组织数据。通过R软件ESTIMATE算法对数据集进行免疫、基质评分，分析评分与宫颈癌预后的关系。根据免疫评分筛选出差异表达基因(DEGs)，并通过韦恩图显示其上调、下调情况，取两数据库所得交集。对关键基因进行GO富集分析、KEGG通路分析和基因集富集分析(GSEA)。构建蛋白质互作(PPI)网络。应用GEPIA2和UALCAN在线网站分析关键基因的表达水平并验证其与患者生存预后的关联性。结果基于TCGA数据库数据分析，高免疫评分组患者的生存情况优于低免疫评分组(log-rank检验：χ2=4.400,P=0.035)。基于TCGA数据库数据，根据免疫评分高低进行筛选，共获得了1 063个DEGs，其中包括640个上调基因和423个下调基因。基于GEO数据库数据共筛选出1 903个DEGs，包括了1 698个上调基因和205个下调基因。取两者交集最终得到7个下调...
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| 关 键 词： | 生物信息学 ESTIMATE算法 宫颈癌 免疫细胞 分子标志物 |
| 收稿时间： | 2021/9/25 0:00:00 |
Screening molecular markers related to cervical cancer immunity based on bioinformatics |
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| LUO Yong-jin,HU Xiao-xi,WANG Dan,et al..Screening molecular markers related to cervical cancer immunity based on bioinformatics[J].Chinese Journal of New Clinical Medicine,2022,15(4):325-331. |
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| Authors: | LUO Yong-jin HU Xiao-xi WANG Dan |
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