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新生小鼠与成年小鼠心肌环状RNA差异表达分析
作者姓名:贾笑冬  于海波  宋海旭  桑占发  梅竹  刘晶  闫承慧
作者单位:1. 北部战区总医院心血管内科;2. 解放军三二二九五部队检验病理科
基金项目:国家自然科学基金面上项目(82070300);
摘    要:目的 探讨新生小鼠(乳鼠)与成年小鼠(成鼠)心肌环状RNA(circRNA)的差异表达情况并阐明其可能的调控机制。方法 选取新生24 h内的雄性C57BL/6J乳鼠和8周龄C57BL/6J雄性成鼠各3只为研究对象。应用RNA提取和转录组芯片杂交的方法检测小鼠左心室组织circRNA的差异表达情况。应用GO和KEGG富集分析获得差异circRNA宿主基因的相关调控网络。分析差异表达circRNA的宿主基因和相互作用的miRNA调控分子。结果 芯片检测获得39个差异表达的circRNA,其中在乳鼠心脏组织中上调表达38个,下调表达1个。GO富集分析显示,上调表达的circRNA主要与蛋白激酶和RNA相关蛋白的反向激活调控有关,而这些宿主基因最主要的信号转导调控通路与有丝分裂调控、流体力学调控和硫基代谢调控有关(P均<0.001)。根据芯片分析结果,获取差异表达倍数>5的circRNA共有5个,分别是上调表达的mmu-circRNA-0001016、mmu-circRNA-0000126、mmu-circRNA-0000663、mmu-circRNA-0000914和下调表达的m...

关 键 词:心肌细胞  增殖  循环RNA  微小RNA
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