| 河南省2010年柯萨奇病毒A组16型VP1区基因特征分析 |
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| 引用本文： | 许玉玲,卫海燕,穆玉姣,黄学勇,许汴利. 河南省2010年柯萨奇病毒A组16型VP1区基因特征分析[J]. 中国自然医学杂志, 2011, 0(3) |
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| 作者姓名： | 许玉玲 卫海燕 穆玉姣 黄学勇 许汴利 |
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| 作者单位： | 河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所实验室; |
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| 基金项目： | 河南省医学科技攻关计划重大项目(201001015) |
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| 摘 要： | 目的了解河南省2010年柯萨奇病毒A组16型(CA16)流行株VP1区基因特征。方法对河南省2010年手足口病(HFMD)粪便和咽拭子样品中分离到的10株CA16病毒,采用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法进行VP1编码区基因扩增,对扩增产物进行测序,利用生物信息学软件对序列分析,与已报道的CA16标准株序列构建基因亲缘关系树。结果 10株CA16毒株,其VP1区核苷酸和氨基酸同源性分别为90.9%~100.0%,99.3%~100.0%,与国际CA16标准株G10在VP1区核苷酸和氨基酸同源性分别为67.0%~69.0%,72.0%~74.0%。亲缘进化树显示全部CA16株可分为A和B两个基因型,B基因型又可分为B1和B2两个基因亚型。河南省分离的CA16毒株全部属于B1基因亚型,同时包含B1a和B1b两条进化分支在河南省共同流行。结论河南省手足口病感染CA16病毒的流行株属B1基因亚型,有B1a和B1b两个进化分支共同进化和循环。
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| 关 键 词： | 手足口病 柯萨奇病毒A组16型 VP1基因 基因型 |
VP1 gene diversity of coxackievirus A16 strains isolated in Henan,2010 |
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| XU Yu-ling,WEI Hai-yan,MU Yu-jiao,HUANG Xue-yong,XU Bian-li Henan Provincial Center for Disease Prevention , Control,Zhengzhou,Henan ,China. VP1 gene diversity of coxackievirus A16 strains isolated in Henan,2010[J]. Chinese Journal of Natural Medicine, 2011, 0(3) |
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| Authors: | XU Yu-ling WEI Hai-yan MU Yu-jiao HUANG Xue-yong XU Bian-li Henan Provincial Center for Disease Prevention Control Zhengzhou Henan China |
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| Affiliation: | XU Yu-ling,WEI Hai-yan,MU Yu-jiao,HUANG Xue-yong,XU Bian-li Henan Provincial Center for Disease Prevention and Control,Zhengzhou,Henan 450016,China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Hand-foot-mouth disease Coxackievirus A16 VP1 gene Genotype |
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