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汉族儿童TPMT基因全蛋白编码区SNP检测与分析
引用本文:谢偲,岳丽杰,陈小文,郑苗苗,杨春兰,丁慧,任艳飞. 汉族儿童TPMT基因全蛋白编码区SNP检测与分析[J]. 临床检验杂志, 2013, 31(9): 683-686
作者姓名:谢偲  岳丽杰  陈小文  郑苗苗  杨春兰  丁慧  任艳飞
作者单位:遵义医学院附属深圳市儿童医院儿科研究所,广东深圳518026;遵义医学院附属深圳市儿童医院儿科研究所,广东深圳518026;遵义医学院附属深圳市儿童医院儿科研究所,广东深圳518026;遵义医学院附属深圳市儿童医院儿科研究所,广东深圳518026;遵义医学院附属深圳市儿童医院儿科研究所,广东深圳518026;遵义医学院附属深圳市儿童医院儿科研究所,广东深圳518026;遵义医学院附属深圳市儿童医院儿科研究所,广东深圳518026
基金项目:国家自然科学基金资助项目(30471830);深圳市科技计划重点项目(201101011)。
摘    要:摘要:目的:分析汉族儿童巯嘌呤甲基转移酶(TPMT)基因的蛋白质编码区(CDS)突变,探讨其在急性白血病(AL)患儿中的单核苷酸多态性(SNP)。 方法:变性梯度凝胶电泳结合DNA测序检测103例AL患儿及111例对照组儿童的TPMT基因CDS碱基位点突变情况。 结果:汉族儿童TPMT基因筛查出2个蛋白编码区单核苷酸多态性(cSNPs),分别为TPMT*3C(A719G)和*1S(C474T)。TPMT*3C AA、AG、GG基因型频率在AL患儿组中分别为95.1%、3.9%和1.0%,在对照组中分别为97.3%、2.7%和0,其G等位基因频率分别为2.9%和1.4%;TPMT*1S CC、CT、TT基因型频率在AL患儿组分别为5.8%、24.3%和69.9%,在对照组中分别为8.1%、28.8%和63.1%,其C等位基因频率分别为18.0%和22.5%。2个cSNPs基因型及等位基因频率在两组中分布差异无统计学意义(P>0.05)。对照组筛查出C210T和TPMT*26(T622C)基因突变。 结论:汉族儿童存在TPMT*26突变基因型,且TPMT*3C、TPMT*1S可能均与儿童AL易感性无关。

关 键 词:巯嘌呤甲基转移酶;急性白血病;变性梯度凝胶电泳;蛋白质编码区;单核苷酸多态性;基因突变
收稿时间:2013-05-24
修稿时间:2013-08-10

Detection and analysis for single nucleotide polymorphism of protein coding region of TPMT gene in Chinese Han children
Abstract:
Keywords:thiopurine methyltransferase   acute leukemia   denaturing gradient gel electrophoresis   protein coding DNA sequence   single nucleotide polymorphism   gene mutation
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