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基于代谢相关基因的乳腺癌预后预测模型的建立和验证题录
作者姓名:李健  王颜  刘飞  张宗旺
作者单位:1. 青岛大学附属泰安市中心医院乳腺疾病诊疗部;2. 山东农业大学信息科学与工程学院应用数学系;3. 聊城市人民医院麻醉科
基金项目:泰安市科技发展计划(引导计划)(2018NS0222);
摘    要:目的构建基于代谢通路相关基因的乳腺癌预后预测模型并进行验证。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载乳腺癌患者的基因表达数据和临床信息, 然后从基因集富集分析(GSEA)网站提取所有代谢通路相关基因进行差异分析, 获得肿瘤和正常组织中的差异表达基因, 再利用单因素Cox和最小绝对收缩和选择算子(LASSO)回归分析筛选出与预后相关的差异代谢基因用于构建预后风险评分。根据风险评分的中位数, 将患者分为高危组和低危组, 利用Kaplan-Meier生存分析、受试者操作特征(ROC)曲线对预后模型进行效能评价, 并将此模型联合其他临床因素构建列线图, 对乳腺癌患者进行生存率预测。最后通过基因表达综合数据库进行验证。结果通过单因素Cox和LASSO回归分析最后共筛选出了6个代谢相关基因(NT5E、PAICS、PFKL、PLA2G2D、QPRT和SHMT2)用于模型构建。在训练集和验证集中, 预后风险评分均是乳腺癌的独立危险因素, Kaplan-Meier生存分析结果提示, 高危组患者的总生存率均显著低于低危组, 差异具有统计学意义(P<0.001)。并且ROC曲线分析结果表明, 该列线...

关 键 词:乳腺肿瘤  代谢  列线图  预测模型  肿瘤微环境
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