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T-ARMS PCR多重检测方法研究
作者姓名:陶明丽  李莹雪  李豪  张威  李传宇  周连群  李金泽
作者单位:1. 中国科学技术大学生命科学与医学部生物医学工程学院(苏州);2. 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
基金项目:国家自然科学基金项目(61874133,61901469,22005331);;江苏省科技项目(BE2019684,BE2020768);
摘    要:目的 建立有错配的加尾双引物扩增受阻突变体系聚合酶链反应(T-ARMS PCR)多重检测的方法,实现针对肝细胞癌常见基因突变位点TP53 R249S、TP53 R273H、CTNNB1 S45F的多重检测。方法 针对3个基因突变位点进行引物设计,每个基因突变位点所设计引物序列的5′端不加一段DNA序列(Tail Free Primer)或者所设计的引物序列5′端加一段相同的DNA序列(Tailed Primer),利用实时荧光定量PCR仪分别检测并比较3个基因突变位点的不同引物序列形成的单重体系、三重体系的扩增结果,研究T-AMRS PCR方法对突变型基因位点突变负荷的检测限、特异性和多靶标检测能力。结果 3个基因突变位点Tailed Primer单重体系扩增结果显示,突变型质粒的扩增均优于野生型质粒,野生型质粒的扩增均被有效抑制,突变负荷检测限低至0.10%,特异性良好。Tailed Primer三重体系减少了引物二聚体的产生,调控CTNNB1 S45F、TP53 R249S、TP53 R273H的解链温度分别为81.11℃、82.36℃、86.35℃,实现不同突变位点的显著区分。与...

关 键 词:有错配的加尾双引物扩增受阻突变体系聚合酶链反应  多重检测  熔解曲线分析  基因突变  肝细胞癌
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