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| 湖南长沙及湘西泡状带绦虫分离株线粒体cox1基因的克隆及序列分析 | |
| 引用本文： | 刘国华,戴荣四,赵光辉,林瑞庆,刘伟,刘毅,朱兴全.湖南长沙及湘西泡状带绦虫分离株线粒体cox1基因的克隆及序列分析[J].热带医学杂志,2009,9(2). |
| 作者姓名： | 刘国华 戴荣四 赵光辉 林瑞庆 刘伟 刘毅 朱兴全 |
| 作者单位： | 1. 湖南农业大学动物医学院,长沙,410128;华南农业大学兽医学院,广州,510642 2. 湖南农业大学动物医学院,长沙,410128 3. 华南农业大学兽医学院,广州,510642 |
| 基金项目： | 教育部“长江学者和创新团队发展计划”创新团队项目(IRT0723) |
| 摘 要： | 目的研究湖南省长沙及湘西泡状带绦虫分离株线粒体细胞色素c氧化酶第I亚基(cox1)基因部分序列(pcox1)的遗传变异情况,并用pcox1序列重构泡状带绦虫与其他带科绦虫的种群遗传关系。方法应用聚合酶链反应(PCR)扩增泡状带绦虫虫株的pcox1,应用ClustalX1.81程序对序列进行比对,然后用Phylip3.67程序MP法和Mage4.0程序NJ法绘制种系发育树,并用Puzzle5.2程序构建最大似然树;同时利用DNAstar5.0中的Megalign程序进行同源性分析,并与GenBankTM中已知泡状带绦虫相应基因序列进行比较分析。结果所获得的pcox1序列长度一致,均为343bp,与GenBankTM公布的带科绦虫序列进行比较分析表明,湖南长沙分离株1和湘西分离株5与已知泡状带绦虫相应基因的相似性分别为99.4%和99.7%,与其它带科绦虫的相似性均小于90.0%;湖南长沙1和湘西分离株5与已知泡状带绦虫相应基因遗传距离分别为0.006和0.003,与其他带科绦虫的遗传距离均大于0.100。种系发育树表明,2个分离株与已知泡状带绦虫位于同一分枝,Bootstrap值在97%以上。结论由于泡状带绦虫... |
| 关 键 词： | 泡状带绦虫 线粒体DNA cox1基因 种系发育关系 |
Cloning and Sequence Analysis of Mitochondrial Cytochrome c Oxidase Subunit 1 from Taenia hydatigena Isolates from Changsha and Xiangxi in Hunan Province |
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| LIU Guo-hua,DAI Rong-si,ZHAO Guang-hui,LIN Rui-qing,LIU Wei,LIU Yi,ZHU Xing-quan.Cloning and Sequence Analysis of Mitochondrial Cytochrome c Oxidase Subunit 1 from Taenia hydatigena Isolates from Changsha and Xiangxi in Hunan Province[J].Journal Of Tropical Medicine,2009,9(2). | |
| Authors: | LIU Guo-hua DAI Rong-si ZHAO Guang-hui LIN Rui-qing LIU Wei LIU Yi ZHU Xing-quan |
| Institution: | 1. College of Animal Science and Technology;Hunan Agricultural University;Changsha 410128;2. College of Veterinary Medicine;South China Agricultural University;Guangzhou 510642;China |
| Abstract: | Objective To analyze whether there are any differences in the cytochrome c oxidase subunit 1 (cox1) gene of Taenia hydatigena strains from Changsha and Xiangxi in Hunan province, and to study the phylogenetic relationship among cestodes of the Taeniidae using cox1 sequences. Method The partial cox1 (pcox1) was amplified from each T.hydatigena sample, and pcox1 sequences were aligned using the ClustalX 1.81. MP and NJ trees were constructed using the software Phylip 3.67 version 4.0 and Mage version 4.0, and... |
| Keywords: | |
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