基于网络药理学和分子对接技术探讨羌活对心律失常的作用机制 |
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作者姓名: | 魏鹏路 邢文龙 李享 龙德怀 谭玉培 刘红旭 |
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作者单位: | 首都医科大学附属北京中医医院,北京 100010;北京中医药大学,北京 100029 |
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基金项目: | 真实世界下活血化瘀类中成药对稳定性冠心病的多中心双向队列研究及循证团队建设;北京市医院管理局重点医学专业发展计划 |
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摘 要: | 目的 基于网络药理学及分子对接技术探索羌活治疗心律失常的作用机制。方法 采用中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)筛选羌活的有效成分及作用靶点;借助Genecards、OMIM数据获得心律失常疾病相关基因;应用STRING平台构建共同靶点蛋白互作网络(PPI);采用cytoscape 3.6.1软件构建药物-成分-靶点互作用网络,同时进行网络分析筛选分子对接的候选成分和靶点;通过cytoscape插件ClueGo对共同靶点进行GO(生物过程)富集分析,并应用R语言进行KEGG(京都基因与基因组百科全书)通路分析。最后,通过Autodock软件进行分子对接。结果 从TCMSP中获取羌活有效成分10种,有效靶点138个,从Genecards、OMIM数据库种获取心律失常相关基因2048个,构建共同靶点的PPI网络以及“药物-成分-靶点”网络,获得羌活治疗心律失常的关键潜在靶点26个,包含CASP、PTGS2、JUN等。这些靶点主要涉及循环系统中的血管过程、神经元死亡的正调控、磷脂C活性的正调控等生物学过程;通路富集显示,这些靶点与心律失常和其他多种疾病(如乙型肝炎、1型人体免疫缺陷病毒...
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关 键 词: | 羌活 心律失常 网络药理学 分子对接 作用机制 钙信号通路 |
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