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丹参类贝壳杉烯氧化酶(SmKOL)基因全长克隆及其生物信息学分析
引用本文:胡雅婷,高伟,刘雨佳,程琪庆,苏平,刘玉忠,陈敏. 丹参类贝壳杉烯氧化酶(SmKOL)基因全长克隆及其生物信息学分析[J]. 中国中药杂志, 2014, 39(21): 4174-4179
作者姓名:胡雅婷  高伟  刘雨佳  程琪庆  苏平  刘玉忠  陈敏
作者单位:中国中医科学院 中药资源中心 道地药材国家重点实验室培育基地, 北京 100700;首都医科大学 中医药学院, 北京 100069;首都医科大学 中医药学院, 北京 100069;首都医科大学 中医药学院, 北京 100069;首都医科大学 中医药学院, 北京 100069;中国中医科学院 中药资源中心 道地药材国家重点实验室培育基地, 北京 100700;中国中医科学院 中药资源中心 道地药材国家重点实验室培育基地, 北京 100700
基金项目:国家杰出青年科学基金项目(81325023);国家自然科学基金项目(81373906,81130070);全国优秀博士学位论文作者专项资金项目(201188)
摘    要:根据丹参转录组数据提供的基因片段设计特异引物,采用RACE方法克隆类贝壳杉烯氧化酶(Sm KOL)全长c DNA,并进行生物信息学分析;采用实时定量PCR检测茉莉酸甲酯(Me JA)诱导丹参毛状根不同时期的Sm KOL表达水平。克隆得到的Sm KOL全长c DNA由1 884个核苷酸组成,具有完整编码框,编码519个氨基酸,蛋白相对分子质量约为58.88 k Da,等电点p I 7.62;实时定量PCR结果表明该基因受Me JA诱导后,表达水平在36 h时达到最大值。从丹参毛状根中克隆得到1条Sm KOL全长c DNA,为进一步研究该基因的功能和丹参次生代谢调控机制提供了靶基因。

关 键 词:丹参  类贝壳杉烯氧化酶  cDNA末端快速扩增  生物信息学分析
收稿时间:2014-05-27

Cloning and bioinformatics analysis of ent-kaurene oxidase synthase gene in Salvia miltiorrhiza
HU Ya-ting,GAO Wei,LIU Yu-ji,CHENG Qi-qing,SU Ping,LIU Yu-zhong and CHEN Min. Cloning and bioinformatics analysis of ent-kaurene oxidase synthase gene in Salvia miltiorrhiza[J]. China Journal of Chinese Materia Medica, 2014, 39(21): 4174-4179
Authors:HU Ya-ting  GAO Wei  LIU Yu-ji  CHENG Qi-qing  SU Ping  LIU Yu-zhong  CHEN Min
Affiliation:State Key Laboratory of Dao-di Herbs, National Resource Center for Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medical Sciences, Beijing 100700, China;School of Traditional Chinese Medicine, Capital Medical University, Beijing 100069, China;School of Traditional Chinese Medicine, Capital Medical University, Beijing 100069, China;School of Traditional Chinese Medicine, Capital Medical University, Beijing 100069, China;School of Traditional Chinese Medicine, Capital Medical University, Beijing 100069, China;State Key Laboratory of Dao-di Herbs, National Resource Center for Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medical Sciences, Beijing 100700, China;State Key Laboratory of Dao-di Herbs, National Resource Center for Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medical Sciences, Beijing 100700, China
Abstract:
Keywords:Salvia miltiorrhiza  ent-kaurene oxidase synthase  rapid-amplification of cDNA ends  bioinformatics analysis
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