| 天王补心丹加减干预睡眠剥夺大鼠能量代谢机制的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 黄晓宇,谢光璟,黄攀攀. 天王补心丹加减干预睡眠剥夺大鼠能量代谢机制的生物信息学分析[J]. 中国实验方剂学杂志, 2020, 26(22): 172-180 |
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| 作者姓名： | 黄晓宇 谢光璟 黄攀攀 |
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| 作者单位： | 湖北中医药大学 基础医学院，武汉 430065 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金面上项目（81874414）；武汉市科技计划项目（2019020701011433） |
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| 摘 要： | 目的:使用基因芯片测序技术测定睡眠剥夺大鼠模型被天王补心丹干预前后,能量代谢相关差异基因功能表达谱的变化,为睡眠剥夺的防治提供可能思路及理论依据。方法:采用多平台水环境法对大鼠进行睡眠剥夺造模后随机分为天王补心丹组和模型组,天王补心丹组按照20 g·kg-1的剂量灌服天王补心丹水煎剂,模型组给予等体积纯水,连续灌胃14 d。取肝、心、下丘脑为样本,高通量测序获取差异基因,采用基因本体(GO)数据库与京都基因与基因组百科全书数据库(KEGG)通路富集分析,并构建与lncRNA的共表达网络,应用实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time PCR)检测其中3个差异性显著的能量代谢关键基因神经肽Y(NPY),双特异性磷酸酶1/丝裂原活化蛋白激酶磷酸酶1(DUSP1/MKP-1),α-L-艾杜糖醛酸酶(IDUA)的mRNA表达水平。结果:得到321个差异基因,其中表达上调231个,下调90个,主要促进脂代谢、糖代谢与蛋白代谢进程;参与纤维蛋白原、维生素B6与星形胶质细胞源性神经营养因子(MANF)的合成表达;涉及丝裂原活化蛋白激酶(MAPK),p53基因(p53),环磷酸腺苷(cAMP)等信号通路。与模型组比较,天王补心丹组IDUA表达水平明显增加(P0.05),NPY和DUSP1表达水平显著降低(P0.01)。结论:天王补心丹从多方面干预睡眠剥夺大鼠的能量代谢机制,通过下调NPY,DUSP1的mRNA表达水平,可能激活参与p38 MAPK信号通路,影响脂质代谢。
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| 关 键 词： | 天王补心丹 睡眠剥夺 能量代谢 生物信息学 差异基因 |
| 收稿时间： | 2020-04-08 |
Bioinformatics Analysis on Mechanism of Modified Tianwang Buxindan Intervention on Energy Metabolism in Sleep Deprived Rats |
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| HUANG Xiao-yu,XIE Guang-jing,HUANG Pan-pan. Bioinformatics Analysis on Mechanism of Modified Tianwang Buxindan Intervention on Energy Metabolism in Sleep Deprived Rats[J]. China Journal of Experimental Traditional Medical Formulae, 2020, 26(22): 172-180 |
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| Authors: | HUANG Xiao-yu XIE Guang-jing HUANG Pan-pan |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Tianwang Buxindan sleep deprivation energy metabolism bioinformatics differential gene |
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