| Alport综合征iPSCs差异性表达新小核糖核苷酸的分析 |
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| 引用本文： | 陈文标,喻祥琪,戴勇.Alport综合征iPSCs差异性表达新小核糖核苷酸的分析[J].山东大学学报(医学版),2015,53(9):80-85. |
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| 作者姓名： | 陈文标 喻祥琪 戴勇 |
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| 作者单位： | 暨南大学第二临床学院, 深圳市人民医院临床医学研究中心, 广东 深圳 518020 |
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| 基金项目： | 广东省深圳市科技计划(JXY20140416122812045) |
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| 摘 要： | 目的 构建Alport综合征(AS)与正常对照者(NC)诱导多能干细胞(iPSCs)新核糖核苷酸(novel microRNA)差异性表达谱,分析其靶基因功能。方法 采用前期工作成功从尿肾状杆细胞诱导成的iPSCs,运用高通量测序平台获得AS与NC的差异性表达谱,使用靶基因预测软件TargetScan进行靶基因预测,靶基因与参考基因比较后,在候选靶基因找到显著富集的GO条目及KEGG通路。结果 在AS与NC中发现49个有意义的差异性表达novel microRNAs,其中33个表达上调,16个表达下调。在GO靶基因富集分析中,靶基因主要富集于生物调节、生物新陈代谢、细胞组成、细胞信号传导、酶催化反应、分子转运等过程。在KEGG通路分析中,靶基因主要参与代谢通路、嘌呤代谢、癌症转录调节等过程。结论 来源于AS与NC的iPSCs存在较大的差异性表达novel microRNA,其靶基因在分子功能、细胞组成、生物过程起着重要作用。这些差异性表达的novel mciroRNAs与靶基因可能是AS发病机制的潜在位点。
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| 关 键 词： | KEGG通路 Alport综合征 诱导多能干细胞 GO富集 小核糖核苷酸 |
| 收稿时间： | 2015-03-21 |
Different expressions of novel microRNAs of iPSCs from Alport syndrome |
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| CHEN Wenbiao,YU Xiangqi,DAI Yong.Different expressions of novel microRNAs of iPSCs from Alport syndrome[J].Journal of Shandong University:Health Sciences,2015,53(9):80-85. |
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| Authors: | CHEN Wenbiao YU Xiangqi DAI Yong |
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| Institution: | Second Clinical Medical College of Jinan University, Clinical Medical Research Center, Shenzhen Peoples Hospital, Shenzhen 518020, Guangdong, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Induced pluripotent stem cells Gene ontology enrichment microRNA Alport syndrome Kyoto encyclopedia of genes and genomes pathway |
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