| 铁皮石斛转录因子基因DoWRKY3的克隆与分子特性分析 |
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| 引用本文： | 张岗,刘思思,彭亮,周丽思,刘亮亮,李欢,黑小斌,沈霞,郭顺星. 铁皮石斛转录因子基因DoWRKY3的克隆与分子特性分析[J]. 中草药, 2017, 48(14): 2930-2936 |
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| 作者姓名： | 张岗 刘思思 彭亮 周丽思 刘亮亮 李欢 黑小斌 沈霞 郭顺星 |
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| 作者单位： | 陕西中医药大学药学院 陕西省中药基础与新药研究重点实验室, 陕西 西安 712046;中国医学科学院 北京协和医学院药用植物研究所, 北京 100193;中国医学科学院 北京协和医学院药用植物研究所, 北京 100193;湖南省林业科学院, 湖南 长沙 410004;陕西中医药大学药学院 陕西省中药基础与新药研究重点实验室, 陕西 西安 712046;中国医学科学院 北京协和医学院药用植物研究所, 北京 100193;陕西中医药大学药学院 陕西省中药基础与新药研究重点实验室, 陕西 西安 712046;陕西中医药大学药学院 陕西省中药基础与新药研究重点实验室, 陕西 西安 712046;陕西中医药大学药学院 陕西省中药基础与新药研究重点实验室, 陕西 西安 712046;陕西中医药大学药学院 陕西省中药基础与新药研究重点实验室, 陕西 西安 712046;中国医学科学院 北京协和医学院药用植物研究所, 北京 100193 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目（31101608）；陕西省自然科学基金项目（2017JM8030）；陕西省青年科技新星项目（2012KJXX-44） |
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| 摘 要： | 目的克隆珍稀濒危药用植物铁皮石斛转录因子基因DoWRKY3,并进行生物信息学和表达模式分析。方法采用RT-PCR和RACE技术获取基因全长;利用生物信息学软件预测蛋白的理化性质、结构域和亚细胞定位等分子特性;用软件DNASTAR 6.0和MEGA 6.0分别进行氨基酸多序列比对和进化关系分析;借助定量PCR检测基因表达模式。结果分离到DoWRKY3基因(GenBank注册号KT957549),cDNA全长2 065 bp,编码1条由509个氨基酸组成的多肽,相对分子质量55 580,等电点6.58;推定的DoWRKY3氨基酸序列具有植物WRKY蛋白家族保守的2个WRKY结构域(217~279、381~449)、2个WRKYGQK位点和2个C_2H_2型锌指结构元件(C-X_4-C-X_(22-23)-H-X_1-H);该蛋白预测无信号肽或跨膜域,定位在细胞核;DoWRKY3蛋白与多种植物WRKY蛋白一致性较高(46.3%~57.4%),与拟南芥At WRKY3、At WRKY4和丹参Sm WRKY54蛋白等亲缘关系近,聚在WRKY分子进化树的Group 1分支;DoWRKY3基因具有组织表达特异性,其转录本在石斛根和叶中表达量较高,分别为茎中的2.32倍和1.69倍。结论 DoWRKY3基因全长的分子克隆与特征分析,为深入研究该基因在铁皮石斛生长发育、逆境生理以及次级代谢调控中的生物学功能奠定基础。
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| 关 键 词： | 铁皮石斛 WRKY 转录因子 克隆 定量PCR |
| 收稿时间： | 2016-12-07 |
Molecular cloning and characterization of a transcription factor gene DoWRKY3 in Dendrobium officinale |
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| ZHANG Gang,LIU Si-si,PENG Liang,ZHOU Li-si,LIU Liang-liang,LI Huan,HEI Xiao-bin,SHEN Xia and GUO Shun-xing. Molecular cloning and characterization of a transcription factor gene DoWRKY3 in Dendrobium officinale[J]. Chinese Traditional and Herbal Drugs, 2017, 48(14): 2930-2936 |
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| Authors: | ZHANG Gang LIU Si-si PENG Liang ZHOU Li-si LIU Liang-liang LI Huan HEI Xiao-bin SHEN Xia GUO Shun-xing |
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| Affiliation: | College of Pharmacy and Shaanxi Provincial Key Laboratory for Chinese Medicine Basis & New Drugs Research, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an 712046, China;Institute of Medicinal Plant Development, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, Beijing 100193, China;Institute of Medicinal Plant Development, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, Beijing 100193, China;Hunan Academy of Forestry, Changsha 410004, China;College of Pharmacy and Shaanxi Provincial Key Laboratory for Chinese Medicine Basis & New Drugs Research, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an 712046, China;Institute of Medicinal Plant Development, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, Beijing 100193, China;College of Pharmacy and Shaanxi Provincial Key Laboratory for Chinese Medicine Basis & New Drugs Research, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an 712046, China;College of Pharmacy and Shaanxi Provincial Key Laboratory for Chinese Medicine Basis & New Drugs Research, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an 712046, China;College of Pharmacy and Shaanxi Provincial Key Laboratory for Chinese Medicine Basis & New Drugs Research, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an 712046, China;College of Pharmacy and Shaanxi Provincial Key Laboratory for Chinese Medicine Basis & New Drugs Research, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an 712046, China;Institute of Medicinal Plant Development, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, Beijing 100193, China |
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