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红树林植物杯萼海桑法呢基焦磷酸合酶的基因克隆及序列分析
引用本文:王 峰,吴秋红,高 辉,张自德,李秀英,张 光.红树林植物杯萼海桑法呢基焦磷酸合酶的基因克隆及序列分析[J].中草药,2013,44(16):2294-2299.
作者姓名:王 峰  吴秋红  高 辉  张自德  李秀英  张 光
作者单位:1. 暨南大学药学院基因组药物研究所,广东广州510632;中药药效物质基础及创新药物研究广东省高校重点实验室,广东广州510632
2. 暨南大学药学院基因组药物研究所,广东广州,510632
摘    要:目的 对杯萼海桑Sonneratia alba萜类化合物生物合成途径的关键酶法呢基焦磷酸合成酶(Farnesyl pyrophosphate synthase,FPS)基因的编码cDNA序列进行克隆,为研究杯萼海桑萜类化合物生物合成与基因调控奠定基础.方法 结合杯萼海桑根的转录组注释,根据编码区序列设计引物,通过PCR方法克隆杯萼海桑FPS (SaFPS)基因的编码区cDNA.结果 PCR扩增了一个长1 029 bp的基因片段,该片段编码由342个氨基酸组成的SaFPS.同源性比对结果显示基因编码蛋白与甘草的FPS具有氨基酸一致性达86%.其具有异戊烯基转移酶的2个典型保守功能域.进化树分析结果显示,与甘草Glycyrrhiza uralensis、苜蓿Medicago truncatula、羽扇豆Lupinus albu具有较近的亲缘关系.实时荧光定量PCR结果显示SaFPS基因在花中表达量较高,果实、茎、叶中表达量相对较低.结论 首次从红树林植物杯萼海桑中克隆FPS基因获得其编码区序列,SaFPS基因具有组织表达特异性.本研究为分析基因表达特性及其在生物合成中的功能奠定基础.

关 键 词:法呢基焦磷酸合成酶  杯萼海桑  基因克隆  PCR  序列分析

Cloning and sequence analysis of Farnesyl pyrophosphate synthase gene in a mangrove tree Sonneratia alba
WANG Feng,WU Qiu-hong,GAO Hui,ZHANG Zi-de,LI Xiu-ying,ZHANG Guang.Cloning and sequence analysis of Farnesyl pyrophosphate synthase gene in a mangrove tree Sonneratia alba[J].Chinese Traditional and Herbal Drugs,2013,44(16):2294-2299.
Authors:WANG Feng  WU Qiu-hong  GAO Hui  ZHANG Zi-de  LI Xiu-ying  ZHANG Guang
Institution:1.Institute of Genomic Medicine, College of Pharmacy, Jinan University, Guangzhou 510632, China 2.Guangdong Province Key Laboratory of Pharmacodynamic Constituents of TCM and New Drugs Research, Jinan University, Guangzhou 510632, China
Abstract:
Keywords:Farnesyl pyrophosphate synthase  Sonneratia alba J  Smith  gene cloning  PCR  sequence analysis
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