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公共数据库GEO分析TGFB1I1在胃癌中表达及临床意义
引用本文:刘梦园,吴瑛,孙明军. 公共数据库GEO分析TGFB1I1在胃癌中表达及临床意义[J]. 临床军医杂志, 2016, 0(8): 862-865. DOI: 10.16680/j.1671-3826.2016.08.29
作者姓名:刘梦园  吴瑛  孙明军
作者单位:1. 中国医科大学附属第一医院内镜科,辽宁沈阳,110001;2. 中国医科大学附属第一医院全科医学科,辽宁沈阳,110001
基金项目:沈阳市科委攻关项目(F13-220-9-30),国家自然科学基金青年项目(81201801)
摘    要:目的利用在线表达谱芯片数据,探讨转化生长因子-β1诱导转录蛋白1(TGFB1I1)在胃癌中的表达情况与临床病理学参数的关系,评价TGFB1I1对胃癌的预后价值。方法利用GEO数据库的胃癌数据集GSE62254和K-M plotter数据库,分析TGFB1I1表达与临床病理参数的相关性及预后。采用基因集富集分析(GSEA)预测TGFB1I1在胃癌中调控的相关基因。结果 TGFB1I1在GSE62254中的表达与性别、年龄无关;与肿瘤浸润深度(P<0.01)、淋巴结转移(P<0.05)、肿瘤分期(P<0.01)、Lauren分型(P<0.01)显著相关。TGFB1I1的表达与胃癌患者的复发和死亡显著相关(P<0.01)。K-M plotter数据库进一步验证,TGFB1I1高表达患者生存期更短(P<0.01)。TGFB1I1高表达的肿瘤样本中富集到粘着斑、细胞外基质受体、钙通路及细胞间隙连接等基因通路。结论利用在线数据库,发现TGFB1I1的表达与胃癌的预后不良临床参数显著相关,TGFB1I1高表达的患者预后更差,并且可以调控细胞粘附、转移相关的分子通路。

关 键 词:胃癌  转化生长因子-β1诱导转录蛋白1  预后  基因集

The expression and the clinical significance of TGFB1I1 in gastric cancer based on GEO database
Abstract:
Keywords:Gastric cancer  TGFB1 I1  Prognosis  Gene sets
本文献已被 万方数据 等数据库收录!
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