| 种子植物matK引物通用性分析研究 |
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| 引用本文： | 石林春,刘金欣,姚辉,徐晓兰,辛天怡,谢彩香,宋经元.种子植物matK引物通用性分析研究[J].世界科学技术-中医药现代化,2013,15(3):381-386. |
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| 作者姓名： | 石林春 刘金欣 姚辉 徐晓兰 辛天怡 谢彩香 宋经元 |
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| 作者单位： | 中国医学科学院/北京协和医学院/药用植物研究所 北京 100193;北京师范大学资源学院资源生态与中药资源研究所 北京 100875;中国医学科学院/北京协和医学院/药用植物研究所 北京 100193;中国医学科学院/北京协和医学院/药用植物研究所 北京 100194;中国医学科学院/北京协和医学院/药用植物研究所 北京 100195;中国医学科学院/北京协和医学院/药用植物研究所 北京 100196;中国医学科学院/北京协和医学院/药用植物研究所 北京 100197 |
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| 基金项目： | 科学技术部国家高技术研究发展计划（“863 计划”）项目（2012AA021602）：基于DNA 条形码的珍稀药用、野生等资源快速检测技术及产品开发，负责人：陈士林；教育部长江学者和创新团队发展计划项目（IRT1150）：中药资源学，负责人：陈士林。 |
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| 摘 要： | matK是植物DNA条形码鉴定的核心序列之一,其引物通用性一直存在争议。然而,matK不同引物通用性的差异及其在不同植物类群中通用性的差异尚缺乏系统研究。本研究收集种子植物36个目,239个科,3 292个属11 429个种的14 563条全长matK序列。利用生物信息学方法,分析13对matK引物及其78种两两引物组合的通用性。结果表明引物xf/5r、1F/8R、390F/1326R和3F_KIM/1R_KIM是通用性最高的4对引物,在所有种子植物中分别为91.18%、84.65%、79.81%和80.94%;不同种子植物类群(目),通用性最高的引物存在差异;xf/5r是引物组合的基础序列,1F/8R、1F/1R、M3/M4和3F_KIM/1R_KIM可作为引物组合的补充引物。本研究为种子植物不同类群(目)DNA条形码鉴定matK序列引物的选择提供有价值的参考。
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| 关 键 词： | DNA条形码 种子植物 matK 引物通用性 |
| 收稿时间： | 2013/5/24 0:00:00 |
| 修稿时间： | 6/4/2013 12:00:00 AM |
Universality Assessment of matK Primer Pairs in Seed Plants |
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| Shi Linchun,Liu Jinxin,Yao Hui,Xu Xiaolan,Xin Tianyi,Xie Caixiang and Song Jingyuan.Universality Assessment of matK Primer Pairs in Seed Plants[J].World Science and Technology-Modernization of Traditional Chinese Medicine,2013,15(3):381-386. |
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| Authors: | Shi Linchun Liu Jinxin Yao Hui Xu Xiaolan Xin Tianyi Xie Caixiang and Song Jingyuan |
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| Institution: | Institute of Medicinal Plant Development, Chinese Academy of Medical Sciences, Peking Union Medical College,
Beijing 100193, China;Beijing Normal University Institute of Resource Ecology and Traditional Chinese Medicine Resources,Beijing 100875, China;Institute of Medicinal Plant Development, Chinese Academy of Medical Sciences, Peking Union Medical College,
Beijing 100193, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | DNA barcoding seed plants matK universality |
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