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对中国人群中III/2a型HCV高变区1序列变异规律的横断研究
引用本文:赵军,程云,陈菊梅,刘茂昌,何卫平,范振平,何江英,赵德成. 对中国人群中III/2a型HCV高变区1序列变异规律的横断研究[J]. 细胞与分子免疫学杂志, 2000, 0(4)
作者姓名:赵军  程云  陈菊梅  刘茂昌  何卫平  范振平  何江英  赵德成
作者单位:解放军302医院免疫室!北京100039
基金项目:全军九五课题基金资助 !No.96M174,98Z089
摘    要:目的研究中国丙型肝炎患者III/2a型丙型肝炎病毒(HCV)包膜蛋白E2/NS1高变区1(HVR1)序列变异的规律及意义。方法应用逆转录巢式PCR技术,从38例III/2a型HCV感染患者血清中 ,扩增HCV部分包膜区基因片断(nt1460~1582,HCV J6),纯化后直接采用双脱氧链末端终止法进行序列分析。结果本组III/2a型HCVHVR1位于氨基酸(aa)384~408位,与有关文献报道的结果(383~410或414位)略有差异。与HCV J ,河北株、HCV 1和HCV J6相应序列比较 ,核苷酸(nt)的同源性依次为 :32 %~56 %(平均45.4 %) ,41.7 %~60.0 %(50.7 %) ,41.3 %~62.7 %(53.3 %)和49.3 %~73.3 %(58.9 %) ;aa的同源性依次为 :16 %~48 %(33.5 %) ,28 %~60 %(42.5 %) ,24 %~64 %(45.3 %)和20 %~64 %(39.4 %)。我们在本组HVR1内发现 ,5个较保守的aa位点:385位为Thr,389 ,390和406位为Gly,403位为Phe,其中390位未见于其它报道。结论本组序列变异集中于aa384~408位 ,且以异义替换为主 ,构成了免疫逃逸的基础 ,但某些位点上序列相对保守,这些位点可能是HCV抗原表位的结构位点。对HVR1序列变异规律及其生物学意义的进一步研究 ,将有助于了解HCV的致病机制及疫苗的研制。

关 键 词:丙型肝炎病毒  高变区1  序列分析  变异

Cross study of sequence diversity in genotype III/2a hepatitis C virus hypervariable region 1 of 38 Chinese patients
ZHAO Jun,CHENG Yun,CHENG Ju mei,LIU Mao chang,HE Wei ping,FAN Zheng ping,HE Jiang yin,ZHAO De cheng. Cross study of sequence diversity in genotype III/2a hepatitis C virus hypervariable region 1 of 38 Chinese patients[J]. Chinese journal of cellular and molecular immunology, 2000, 0(4)
Authors:ZHAO Jun  CHENG Yun  CHENG Ju mei  LIU Mao chang  HE Wei ping  FAN Zheng ping  HE Jiang yin  ZHAO De cheng
Affiliation:ZHAO Jun,CHENG Yun,CHENG Ju mei,LIU Mao chang,HE Wei ping,FAN Zheng ping,HE Jiang yin,ZHAO De cheng Department of Immunology,Institute of Infectious Diseases,Beijing 100039,China
Abstract:
Keywords:hepatitis C virus  HVR1  sequence analysis  diversity
本文献已被 CNKI 等数据库收录!
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