| 铁皮石斛蛋白磷酸酶DoPP2C1基因的克隆与表达分析 |
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| 引用本文： | 张娜,刘亮亮,李欢,黑小斌,白庆庆,郑丽,郭顺星,张岗. 铁皮石斛蛋白磷酸酶DoPP2C1基因的克隆与表达分析[J]. 中草药, 2018, 49(7): 1661-1666 |
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| 作者姓名： | 张娜 刘亮亮 李欢 黑小斌 白庆庆 郑丽 郭顺星 张岗 |
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| 作者单位： | 陕西中医药大学药学院 陕西省中药基础与新药研究重点实验室, 陕西 西安 712046,陕西中医药大学药学院 陕西省中药基础与新药研究重点实验室, 陕西 西安 712046;中国医学科学院 北京协和医学院药用植物研究所, 北京 100193,陕西中医药大学药学院 陕西省中药基础与新药研究重点实验室, 陕西 西安 712046,陕西中医药大学药学院 陕西省中药基础与新药研究重点实验室, 陕西 西安 712046,陕西中医药大学药学院 陕西省中药基础与新药研究重点实验室, 陕西 西安 712046,陕西中医药大学药学院 陕西省中药基础与新药研究重点实验室, 陕西 西安 712046,中国医学科学院 北京协和医学院药用植物研究所, 北京 100193,陕西中医药大学药学院 陕西省中药基础与新药研究重点实验室, 陕西 西安 712046;中国医学科学院 北京协和医学院药用植物研究所, 北京 100193 |
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| 基金项目： | 中国医学科学院医学与健康科技创新工程经费（2017-I2M-3-013）；陕西省普通高校青年杰出人才支持计划项目；咸阳市中青年科技创新领军人才项目 |
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| 摘 要： | 目的克隆珍稀濒危兰科药用植物铁皮石斛蛋白磷酸酶(protein phosphatase,PP)DoPP2C1基因,并进行生物信息学和表达模式分析。方法采用实时定量PCR(qRT-PCR)和RACE技术获基因全长;利用生物信息学软件预测蛋白的理化性质、结构域和亚细胞定位等分子特性;用DNASTAR 7.0和MEGA 6.0分别进行氨基酸多序列比对和进化关系分析;借助qRT-PCR检测基因表达模式。结果分离到DoPP2C1基因(Gen Bank注册号KJ995533),cDNA全长1 221 bp,编码1条由285个氨基酸组成的多肽,相对分子质量31 080,等电点6.18;推定的DoPP2C1氨基酸序列具有植物PP2C蛋白家族保守的1个PP2C结构域(27-285);该蛋白预测无信号肽或跨膜域,定位在细胞质;DoPP2C1蛋白与多种植物PP2C蛋白一致性较高(56.3%~73.7%),与水稻OsPP2C62、高粱XP_002462907、大麦BAK00362和乌拉尔图小麦EMS47641蛋白等亲缘关系近,聚在PP2C分子进化树的F1分支;DoPP2C1基因具有组织表达特异性,其转录本在石斛根和茎中表达量较高,分别为叶中的7.57倍和1.79倍。结论获得DoPP2C1基因分子特征,为深入研究该基因在铁皮石斛生长发育、逆境生理以及次级代谢调控中的生物学功能奠定基础。
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| 关 键 词： | 铁皮石斛 蛋白磷酸酶 生物信息学分析 实时定量PCR DoPP2C1基因 |
| 收稿时间： | 2017-10-10 |
Cloning and expression analysis on a protein phosphatase encoding gene DoPP2C1 in Dendrobium officinale |
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| ZHANG N,LIU Liang-liang,LI Huan,HEI Xiao-bin,BAI Qing-qing,ZHENG Li,GUO Shun-xing and ZHANG Gang. Cloning and expression analysis on a protein phosphatase encoding gene DoPP2C1 in Dendrobium officinale[J]. Chinese Traditional and Herbal Drugs, 2018, 49(7): 1661-1666 |
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| Authors: | ZHANG N LIU Liang-liang LI Huan HEI Xiao-bin BAI Qing-qing ZHENG Li GUO Shun-xing ZHANG Gang |
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| Affiliation: | Shaanxi Provincial Key Laboratory for Chinese Medicine Basis & New Drugs Research, College of Pharmacy, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an, 712046, China,Shaanxi Provincial Key Laboratory for Chinese Medicine Basis & New Drugs Research, College of Pharmacy, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an, 712046, China;Institute of Medicinal Plant Development, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, Beijing 100193, China,Shaanxi Provincial Key Laboratory for Chinese Medicine Basis & New Drugs Research, College of Pharmacy, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an, 712046, China,Shaanxi Provincial Key Laboratory for Chinese Medicine Basis & New Drugs Research, College of Pharmacy, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an, 712046, China,Shaanxi Provincial Key Laboratory for Chinese Medicine Basis & New Drugs Research, College of Pharmacy, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an, 712046, China,Shaanxi Provincial Key Laboratory for Chinese Medicine Basis & New Drugs Research, College of Pharmacy, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an, 712046, China,Institute of Medicinal Plant Development, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, Beijing 100193, China and Shaanxi Provincial Key Laboratory for Chinese Medicine Basis & New Drugs Research, College of Pharmacy, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an, 712046, China;Institute of Medicinal Plant Development, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, Beijing 100193, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Dendrobium officinale Kimura et Migo protein phosphatases bioinformatics analysis qRT-PCR DoPP2C1 gene |
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