1株LpsB突变致多黏菌素B耐药鲍曼不动杆菌的全基因测序分析* |
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引用本文: | 杨玮,张思琴,陈福红,李素娟.1株LpsB突变致多黏菌素B耐药鲍曼不动杆菌的全基因测序分析*[J].临床检验杂志,2023,41(2):111-116. |
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作者姓名: | 杨玮 张思琴 陈福红 李素娟 |
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作者单位: | 杭州市中医院检验科 |
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基金项目: | 浙江省卫健委资助项目(2018PY048) |
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摘 要: | 目的 研究1株多黏菌素B高水平耐药的多重耐药鲍曼不动杆菌的全基因组测序的分子特点。方法 将1株分离自脑脓肿患者脑脊液标本的多黏菌素高水平耐药鲍曼不动杆菌Z198株作为目标研究菌,通过Nanopore PromethION和Illumina NovaSeq PE150测序平台对其进行全基因组测序,再通过各数据库进行比对分析检测菌株的多位点序列分型(MLST)、抗菌药物耐药基因、毒力基因,同时采用Circos软件对样品基因组组装和注释结果进行可视化分析。Z198基因组上交NCBI数据库。结果 全基因组测序发现该菌株含有1个染色体、1个固有质粒,11个基因岛、4个前噬菌体。通过数据库比对,本菌为ST2型,共携带高达34种抗菌药物耐药基因,主要为LpsB、blaOXA-23、blaOXA-66、blaADC-73等,同时含有OmpA、磷脂酶C、包膜、溶血素、生物膜调控系统等19种主要毒力因子。结论 本研究检出1例LpsB四点突变导致多黏菌素B耐药的鲍曼不动杆菌。该菌株同时携带多重耐药基因及毒力因子。多黏菌素耐药鲍曼不动杆菌外膜脂...
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关 键 词: | 多黏菌素耐药的鲍曼不动杆菌 全基因组测序 LpsB 多位点序列分型 |
收稿时间: | 2022/10/26 0:00:00 |
Whole gene sequencing analysis for a polymyxin B resistant strain of Acinetobacter baumannii with LpsB mutation |
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Abstract: | |
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Keywords: | Key words: polymyxin B resistant Acinetobacter baumanii whole genome sequencing LpsB multilocus sequence typing |
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