一起诺如病毒GⅡ.17型引起的急性胃肠炎病原学诊断及基因特征分析 |
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引用本文: | 姚栋,陈静芳,叶文,欧新华.一起诺如病毒GⅡ.17型引起的急性胃肠炎病原学诊断及基因特征分析[J].中国人兽共患病杂志,2016(7). |
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作者姓名: | 姚栋 陈静芳 叶文 欧新华 |
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作者单位: | 长沙市疾病预防控制中心,长沙,410001 |
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摘 要: | 目的对长沙市2014年12月某厂区暴发的一起急性胃肠炎疫情进行病原学诊断及对其致病原进一步的基因分型研究。方法共采集6例病人肛拭子标本和可疑水源标本4份,提取核酸后,诺如病毒GI/GII型real-time RT-PCR试剂盒检测;阳性标本普通RT-PCR扩增VP1基因片段,产物测序后BLAST比对确定其型别,并构建进化树分析其进化关系。结果 10份标本real-time RT-PCR扩增结果显示为诺如病毒GII型,VP1区片段RT-PCR扩增后产物测序,BLAST比对发现与2014年香港诺如病毒株GII/Hu/HKG/2014/GII.17/CUHK-NS-463同源性最高,达99%,证实为诺如病毒GII.17型;构建系统进化树分析显示本次疫情分离的毒株与日本、香港、台湾等亚洲地区的毒株亲缘关系更为接近,而与美国、法国等地区的毒株亲缘关系则较远。结论诺如病毒是引起此次急性胃肠炎疫情的病原体,且引起暴发的病毒株属于GII.17型。
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关 键 词: | 诺如病毒 胃肠炎 分子分型 |
Etiology and genotype features analysis of an acute gastroenteritis outbreak associated with Norovirus GⅡ.17 |
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Abstract: | |
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Keywords: | norovirus gastroenteritis genotype |
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