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基因型错误对定位QTL的LD指数的效应
作者姓名:李玉梅  向阳  孙振球
作者单位:怀化学院数学系;中南大学公共卫生学院;
摘    要:连锁不平衡(LD)在基因定位中起着关键作用,因而是现代遗传研究中的一个重要工具。但是,连锁不平衡背景的估计受多种因素的影响,其中之一就是基因型错误。已经有研究考察了基因型错误对四个常用LD 指数D, r, Q, 和d的影响。而基因型错误对于定位数量性状位点(QTL)的LD 指数的效应还没有得到研究。本文从分析的角度调查了基因型错误存在时LD 指数lx 的性质。结果表明,指数lx 因依赖于基因型错误率因而值变小了,当基因型错误率达到0.03, lx值的改变量(减小值)将超过50%,特别是在标记基因频率比较高的时候。基因型错误的影响也通过基于血管紧张肽转化酶(ACE)基因的10个SNPs单体型频率的模拟研究得到了证实。

关 键 词:连锁不平衡  基因型错误  数量性状位点  精细定位  效应  
收稿时间:2009-02-16
修稿时间:2009-06-03
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