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TAB1——基于蛋白质组学的卵巢癌紫杉醇耐药的潜在生物标志物探讨
引用本文:丁亚伟,陈君君,张湘奇,张葳,周丽,孔欠文,石美智,姜波,周阳云,汪晓河,许剑锋,韩永龙,杨姣.TAB1——基于蛋白质组学的卵巢癌紫杉醇耐药的潜在生物标志物探讨[J].中国实验方剂学杂志,2021,27(8):168-178.
作者姓名:丁亚伟  陈君君  张湘奇  张葳  周丽  孔欠文  石美智  姜波  周阳云  汪晓河  许剑锋  韩永龙  杨姣
作者单位:上海海洋大学食品学院;农业部水产品贮藏保鲜质量安全风险评估实验室;上海交通大学附属第六人民医院
基金项目:国家自然科学基金项目(81773949,82003987);上海市自然科学基金项目(20ZR1442400);上海市卫生和计划生育委员会中医药科研课题(2018YP003);上海市浦东新区科技发展基金民生科研专项资金项目(PKJ2020-Y08);上海市第六人民医院医疗集团课题;中国药学会全国医药经济信息网科技传播创新工程(CME12019KPYJ00421)。
摘    要:目的:探究卵巢癌对紫杉醇(PTX)耐药的潜在靶点及其相关机制。方法:体外培养卵巢癌A2780细胞和A2780PTX耐药细胞(A2780/T),采用不同浓度(2,4,8,16,32,64,128,256μmol·L-1)PTX分别干预24 h或48 h,噻唑蓝(MTT)比色法检测PTX对A2780细胞和A2780/T细胞存活率的影响,利用液相色谱质谱/质谱(LC-MS/MS)非标记(Label-Free)定量蛋白质组学方法鉴定和筛选两组细胞中表达差异的蛋白,通过基因本体(GO)注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,筛选卵巢癌细胞对PTX耐药的潜在生物标志物。以正常培养的A2780细胞作为空白组,采用0,1,4μmol·L-1的PTX处理A2780/T细胞,采用实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time PCR)和蛋白免疫印迹法(Western blot)检测验证潜在靶点转化生长因子-β活化激酶1结合蛋白1(TAB1)及其下游相关分子转化生长因子-β活化激酶1(TAK1),p38有丝分裂活化蛋白酶(MAPK)mRNA和蛋白的表达水平。结果:与空白组比较,PTX干预组的A2780和A2780/T细胞的活力均降低。PTX对A2780细胞的抑制率明显高于A2780/T细胞。A2780细胞中,PTX处理48 h的半抑制浓度(IC50)为0.002μmol·L-1,A2780/T细胞中,PTX的IC50>设置的最高浓度128μmol·L-1,与A2780细胞相比,A2780/T细胞对PTX具有耐药性。通过非标记定量蛋白质组学分析筛选出A2780/T和A2780细胞之间有441种差异表达蛋白和421种特殊差异表达蛋白。GO功能富集分析显示,在差异表达的蛋白质中,结合蛋白占大多数(80%)。根据KEGG通路分析结果和表达位点分析,TAB1被认为可能是卵巢癌对PTX耐药的潜在生物标志物。与A2780细胞比较,A2780/T细胞的TAB1 mRNA和蛋白表达显著降低(P<0.01),与TAB1相互作用的TAK1 mRNA和p38 MAPK mRNA亦明显降低(P<0.05,P<0.01),但蛋白表达无显著变化。结论:TAB1可能是卵巢癌对PTX耐药的潜在生物标志物,其机制可能与TAB1/TAK1/p38 MAPK通路有关。

关 键 词:转化生长因子-β活化激酶1结合蛋白1(TAB1)  卵巢癌  紫杉醇耐药  非标记定量蛋白组学  生物信息学
收稿时间:2020/12/3 0:00:00
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