| 牡蛎中诺如病毒检测的前处理方法比较及应用 |
| |
| 引用本文： | 严寒秋,霍达,刘白薇,高志勇,李伟红,杜轶威,梁志超,杨扬,陈丽娟. 牡蛎中诺如病毒检测的前处理方法比较及应用[J]. 国际病毒学杂志, 2015, 22(3) |
| |
| 作者姓名： | 严寒秋 霍达 刘白薇 高志勇 李伟红 杜轶威 梁志超 杨扬 陈丽娟 |
| |
| 作者单位： | 食物中毒诊断溯源技术北京市重点实验室, 北京 北京市疾病预防控制中心,100013 |
| |
| 基金项目： | 北京市自然科学基金项目，食物中毒诊断溯源技术北京市重点实验室开放基金 |
| |
| 摘 要： | 目的 对牡蛎中诺如病毒检测的三种前处理方法进行比较并探讨应用策略.方法 2014年8月-2015年3月采集160只市售牡蛎,每组5只,共32组样品,取其肠腺组织采用直接处理法(M1)、PEG 8000沉淀法(M2)和蛋白酶K消化-PEG 8000沉淀法(M3)三种方法进行前处理,提取核酸后荧光定量RT-PCR检测诺如病毒核酸.应用串并联法对三种前处理方法的样品阳性率进行分析,利用x2检验比较不同方法的阳性率差异,应用一致性检验比较不同方法的一致性,对荧光RT-PCR所得到的Ct值进行ANOVA检验.结果 M1、M2、M3三种前处理方法诺如病毒阳性率依次为15.63％(5/32)、34.38％ (11/32)和37.50％ (12/32);M1/M2/M3并联使用的阳性率最高,为50.00％ (16/32);其次为M2/M3并联法,阳性率为46.88％ (15/32);M1+ M3串联或M1+ M2+ M3串联的阳性率最低,均为9.38％ (3/32).M2/M3与M1/M2/M3的阳性率经x2检验比较,差异无统计学意义(P＞0.05),两种方法经一致性检验,kappa=0.931(P＜0.05),一致性较高.M1、M2、M3三种方法检测阳性样品的Ct值依次为33.44±0.66、33.70±1.88和33.42±2.44.经ANOVA检验,差异无统计学意义(P＞0.05).结论 常规监测时推荐使用M2或M3,暴发疫情溯源时可考虑使用M2/M3并联法.
|
| 关 键 词： | 牡蛎 诺如病毒 前处理 荧光定量RT-PCR |
Comparison and application of pretreatment methods for norovirus detection in oysters |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | Oyster Norovirus Pretreatment Real time RT-PCR |
| 本文献已被 万方数据 等数据库收录！ |
|
