| 铜绿假单胞菌PAO1株基因组中2个SOS盒序列的初步鉴定 |
| |
| 引用本文： | 张克斌,周世文,光丽霞,何晓梅,盛哈雷,张国斌,钱桂生. 铜绿假单胞菌PAO1株基因组中2个SOS盒序列的初步鉴定[J]. 第三军医大学学报, 2009, 31(11): 1032-1036 |
| |
| 作者姓名： | 张克斌 周世文 光丽霞 何晓梅 盛哈雷 张国斌 钱桂生 |
| |
| 作者单位： | 第三军医大学新桥医院医学实验技术中心,重庆,400037;第三军医大学新桥医院全军呼吸内科研究所,全军呼吸病研究重点实验室,重庆,400037 |
| |
| 基金项目： | 重庆市自然科学基金，第三军医大学新桥医院人才基金 |
| |
| 摘 要： | 目的 鉴定铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa,PA)PAO1株基因组中的SOS盒序列.方法 挑选铜绿假单胞菌PAO1株基因组中16个可能含有SOS盒序列的DNA片段,经PCR扩增后,用纯化的LexA表达蛋白做凝胶滞后实验;将获得的2个阳性DNA片段进一步用DNase Ⅰ足纹法进行LexA蛋白结合序列即SOS盒的鉴定;分析所获得的2个SOS盒中的回文序列,以此回文序列在PAO1基因组中进行检索,初步分析出可能的SOS盒序列和可能的调控基因.结果 通过DNase Ⅰ足纹法初步鉴定了PAO1基因组中2个SOS盒序列,即位于基因组4 052 647～4 052 662 bp位置的CTGTCTACTFATACAG序列和5 349 888～5 349 903 bp位置的CTGTATAAATAACCAC序列,分析其回文结构为"CTG…CAG",以此回文序列在基因组中进行检索,共获得了10个候选的SOS盒序列.结论 初步证实了PAO1基因组中的2个SOS盒,并获得了10条SOS盒候选序列.
|
| 关 键 词： | 铜绿假单胞菌PAO1株 SOS盒 LexA蛋白 回文序列 凝胶滞后实验 DNase Ⅰ足纹法 |
Primary identification on sequences of 2 SOS boxes in genome of Pseudomonas aeruginosa PAO1 |
| |
| ZHANG Ke-bin,ZHOU Shi-wen,GUANG Li-xia,HE Xiao-mei,SHENG Ha-lei,ZHANG Guo-bin,QIAN Gui-sheng. Primary identification on sequences of 2 SOS boxes in genome of Pseudomonas aeruginosa PAO1[J]. Acta Academiae Medicinae Militaris Tertiae, 2009, 31(11): 1032-1036 |
| |
| Authors: | ZHANG Ke-bin ZHOU Shi-wen GUANG Li-xia HE Xiao-mei SHENG Ha-lei ZHANG Guo-bin QIAN Gui-sheng |
| |
| Affiliation: | ZHANG Ke-bin1,ZHOU Shi-wen1,GUANG Li-xia1,HE Xiao-mei1,SHENG Ha-lei1,ZHANG Guo-bin1,QIAN Gui-sheng2(1Center of Medical Experiment and Technology,2Institute of Respiratory Diseases,Xinqiao Hospital,Third Military Medical University,Chongqing 400037,China) |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
|
