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移行上皮反应基因TERE1的结构与功能分析
引用本文:夏炎枝,赵为,魏雄,吴时敏,王西明,红凌.移行上皮反应基因TERE1的结构与功能分析[J].中国现代医学杂志,2011,21(8).
作者姓名:夏炎枝  赵为  魏雄  吴时敏  王西明  红凌
作者单位:1. 华中科技大学生命科学与技术学院,分子生物物理教育部重点实验室,湖北,武汉,430074
2. 华中科技大学同济医学院附属同济医院病理研究所,病理学与病理生理学教育部国家重点学科,湖北,武汉,430030
3. 华中科技大学同济医学院基础医学院,生物化学与分子生物学系,湖北,武汉,430030
基金项目:国家自然科学基金(No:30971608); 湖北省自然科学基金(No:2009CDB074); 华中科技大学校自主创新基金(No:M2009050); 2008教育部优秀博士学位论文创新基金资助
摘    要:目的 用生物信息软件分析移行上皮反应基因TERE1蛋白的跨膜结构,并预测分析其重要蛋白结构域功能.检测TERE1在细胞中表达定位.方法 采用不同生物信息学软件预测分析TERE1的蛋白跨膜结构及重要结构域功能.采用分子克隆方法构建绿色荧光蛋白-移行上皮反应基因(pEGFP-TERE1)重组质粒,转染人膀胱癌细胞系T24,激光共聚焦显微镜观察TERE1在细胞中表达定位.结果 TERE1蛋白为多次跨膜的蛋白,保守的区域形成3个环loop 1、loop 2和loop 3;N端和loop 1合有高度保守的位点;以loop 2和loop 3之间的区域采用PROSITE软件分析显示UbiA类异戊烯转移酶家族具有一致性序列.采用菌液PCR、双酶切鉴定和DNA测序验证pEGFP-TERE1重组质粒构建成功.TERE1主要在T24细胞浆中表达.结论 TERE1为多次跨膜的蛋白,保守的区域形成3个环,UbiA类异戊烯转移酶家族具有一致性序列.TERE1主要在T24细胞浆中表达.

关 键 词:移行上皮反应基因  膀胱癌  UbiA类异戊烯转移酶功能域1  生物信息

Structural and functional analysis of transitional epithelial response gene TERE1
XIA Yan-zhi , ZHAO Wei , WEI Xiong , WU Shi-min , WANG Xi-ming , HONG Ling.Structural and functional analysis of transitional epithelial response gene TERE1[J].China Journal of Modern Medicine,2011,21(8).
Authors:XIA Yan-zhi  ZHAO Wei  WEI Xiong  WU Shi-min  WANG Xi-ming  HONG Ling
Institution:XIA Yan-zhi1,ZHAO Wei1,WEI Xiong1,WU Shi-min3,WANG Xi-ming2,HONG Ling1(1.Key Laboratory of Molecular Biophysics,Ministry of Education,College of Life Science and Technology,Huazhong University of Science and Technology,Wuhan,Hubei 430074,P.R.China,2.Department of Biochemistry and Molecular Biology,Tongji Medical College,Hubei 430030,3.National Key Discipline,Pathology and Pathophysiology,Institute of Pathology,Tongji Hospita...
Abstract:
Keywords:transitional epithelial response gene  UbiA prenyltransferase domain containing 1  bladder cancer  prenyltransferase  bioinformatics  
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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