加权基因共表达网络分析在鉴定卵巢癌干细胞特性关键基因的应用

  目的  探讨关键干细胞特性基因在卵巢癌的诊断和治疗中的意义。  方法  加权基因共表达网络分析（WGCNA）方法筛选出关键模块和基因；基因集富集分析（GSEA）和单细胞测序数据分析关键基因上调组高表达的信号通路；pRRophetic预测卵巢癌的化疗药物的敏感性；流式细胞术检测SKOV3细胞和肿瘤干细胞中CD44及CD117的表达情况；实时荧光定量（qRT）-PCR证实关键基因在卵巢癌干细胞中的表达；GeneMANIA分析鉴定出核心基因。  结果  WGCNA结果显示在转录水平上筛选出15个关键基因，其在多种肿瘤中高表达，参与细胞周期、DNA修复、E2靶点和G2M检查点通路，且与化疗药物敏感性有显著的关联性。CD44+CD117+细胞在SKOV3细胞和卵巢癌干细胞中的比例分别为（1.20±0.34）%、（37.17±1.80）%，差异有统计学意义（P<0.05）。qRT-PCR证实WGCNA结果中7个关键基因（BUB1、CDC20、CCNB2、DLGAP5、KIF4A、NEK2、NUSAP1）在卵巢癌干细胞中高表达，并且BUB1可能起着核心的作用。  结论  本研究通过构建基因共表达网络筛选出7个干细胞特性关键基因，尤其是BUB1，可能成为潜在的卵巢癌基因生物标志物。

Identification of Hub Genes for Ovarian Cancer Stem Cell Properties with Weighted Gene Co-expression Network Analysis