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分子动力学模拟、结合自由能计算和3D-QSAR研究大麻Ⅱ型受体和其激动剂的相互作用(英文)
作者姓名:陈炯炯  韩爽  曹扬  陈建忠
作者单位:浙江大学药学院
基金项目:supported by the National Natural Science Foundation of China(NSFC30973637);Qianjiang talents project of technology office in Zhejiang province(2010R10048)
摘    要:CB2是一类主要表达于人体免疫系统的G蛋白偶联受体,已成为研发治疗免疫系统疾病药物的良好靶点。本论文基于CB2同源蛋白模型,结合分子对接和分子力学/分子动力学模拟研究CB2与其激动剂复合物在磷脂双分子层膜体系DPPC/TIP3P中的三维结构模型,分别运用MM-PBSA和MM-GBSA方法计算结合自由能和能量分解。计算结果表明,CB2与其配体的主要结合作用力是范德华力,关键性氨基酸Phe197对于结合选择性激动剂至关重要。另外,以分子动力学模拟得到的激动剂稳定构象为模板,运用CoMFA方法建立相应的三维定量构效关系模型。结合分子模拟得到的作用模式和3D-QSAR模型提供的活性结构特征将有助于指导设计新型、高效的CB2选择性激动剂。

关 键 词:CB2  激动剂  分子动力学模拟  结合自由能  3D-QSAR
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