| HER2高表达胃癌细胞中miR-4728-3p表达及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 王冬,张健,于景翠.HER2高表达胃癌细胞中miR-4728-3p表达及生物信息学分析[J].国际遗传学杂志,2017,40(4). |
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| 作者姓名： | 王冬 张健 于景翠 |
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| 作者单位： | 哈尔滨医科大学附属第二医院科研实验中心,150081 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31171227)National Natural Science Foundation of China |
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| 摘 要： | 目的 探讨HER2高表达的胃癌细胞中miR-4728-3p表达状况及其调控靶基因所涉及的信号通路,旨在初步分析miR-4728-3p在胃癌中的作用机制及其与HER2的相关性.方法 首先采用Real-time PCR技术检测胃癌细胞株NCI-N87中miR-4728-3p及HER2 mRNA,然后通过miRanda、DIANA-microT、Targetscan和Targetmine软件预测miR-4728可能的靶基因,并通过DAVID数据库进行靶基因功能富集分析及信号转导通路富集分析.结果 miR-4728-3p及HER2 mRNA在胃癌细胞中均高表达,二者呈正相关(r=0.990,P=0.000).miR-4728-3p预测靶基因共有54个,靶基因功能主要富集于转录活性调节(P=0.014)、DNA结合(P=0.019)及蛋白质磷酸化氨基酸结合(P=0.036)等分子功能,RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录调控(P=0.001)、转录调控(P=0.003)及细胞内信号级联(P=0.021)等生物学过程以及轴突部分(P=0.008)等细胞组分上;信号转导通路则主要富集于肿瘤通路(P=0.013)和卵母细胞减数分裂通路(P=0.041).结论 miR-4728-3p在HER2高表达的胃癌细胞中表达上调,二者表达呈正相关;生物信息学分析提示miR-4728-3p通过调控其靶基因参与胃癌的发生发展.
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| 关 键 词： | HER2高表达 胃癌细胞 miR-4728-3p 生物信息学分析 |
Expression and bioinformatics analysis of miR-4728-3p in gastric cancer cells with HER2 overexpression |
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| Wang Dong,Zhang Jian,Yu Jingcui.Expression and bioinformatics analysis of miR-4728-3p in gastric cancer cells with HER2 overexpression[J].International JOurnal of Genetics,2017,40(4). |
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| Authors: | Wang Dong Zhang Jian Yu Jingcui |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | HER2 overexpression Gastric cancer cells miR-4728-3p Bioinformatics analysis |
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