禽流感病毒(H5N1型)血凝素(HA)T细胞抗原表位的预测

目的：应用免疫信息学的方法寻找不同来源的H5NI型禽流感病毒血凝素（HA）的共同抗原决定簇，为发展H5NI型禽流感病毒的表位疫苗打基础。方法：从GeneBank下载不同来源的H5NI型禽流感病毒血凝素（HA）的氨基酸序列，先使用Clustal W1．83生物软件对这些氨基酸序列进行同源性比较，然后使用SYFPEITHI生物学软件分析不同来源氨基酸序列的MHCI类分子提呈的抗原肽（抗原决定簇），最后寻找共同的、且和MHCI类分子结合比较强的抗原肽。结果：不同来源的氨基酸序列同源性虽然不尽相同，但是，他们之间也有一些相同的、并且和MHCI类分子结合比较强的抗原肽。结论：利用这些相同的、并且和MHCI类分子结合比较强的抗原肽有可能发展H5NI型禽流感病毒表位疫苗，用来预防H5NI型禽流感。

Prediction of the epitopes on HA of avian influenza virus (H5N1)