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PGM2 在脑胶质瘤中的表达及临床意义
引用本文:沈若菲,蒋传路,蔡金全.PGM2 在脑胶质瘤中的表达及临床意义[J].神经疾病与精神卫生,2024(5).
作者姓名:沈若菲  蒋传路  蔡金全
作者单位:哈尔滨医科大学附属第二医院神经外科
摘    要:目的 探讨磷酸葡糖变位酶 2(PGM2)在脑胶质瘤中的表达及临床意义。方法 提取 中国胶质瘤基因组图谱计划(CGGA)数据库和癌症基因组图谱计划(TCGA)数据库中脑胶质瘤患者的临 床数据和 mRNA 测序数据,将测序数据与临床数据相匹配后提取PGM2基因的表达情况,并剔除临床数 据缺失的病例。根据受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线获得的临界值(Cut-off值) 将病例分为PGM2高表达组和PGM2低表达组。采用 ROC 曲线下面积(AUC)和 Kaplan-Meier 生存曲线评 价PGM2表达水平对胶质瘤患者总生存率的预测价值。采用单因素分析影响PGM2表达水平的胶质瘤 临床病理因素。采用单因素、多因素 Cox 回归分析脑胶质瘤相关临床病理因素和PGM2表达与胶质瘤患 者预后的关系。通过筛选共表达基因,进行基因本体(GO)富集分析和 KEGG 通路分析,探讨PGM2参与 生物学过程以及调控的相关信号通路。采用 CIBERSORT 算法分析胶质瘤PGM2表达与免疫细胞浸润 的关系。结果 CGGA-325 数据库剔除缺失值后余 273 例,TCGA 数据库剔除缺失值后余 560 例。PGM2 表达量预测胶质瘤患者总生存率的 ROC 曲线分析显示,其在 CGGA-325 数据库中的AUC为 0.705(95%CI: 0.640~0.769),Cut-off 值为 10.1;在 TCGA 数据库中的AUC为 0.739(95%CI:0.699~0.778),Cut-off 值为 8.9。根据 Cut-off 值将病例分为PGM2高表达组和 PGM2 低表达组。Kaplan-Meier 生存分析显示,PGM2 高表达组患者的总生存率较PGM2低表达组患者下降,差异有统计学意义(P< 0.001)。CGGA-325 和 TCGA 数据库中,PGM2低表达与高表达组的胶质瘤级别、IDH分型以及 1p/19q 缺失情况比较,差异均有 统计学意义(均P< 0.05)。多因素 Cox 回归分析显示,CGGA-325 数据库与 TCGA 数据库中胶质瘤共同 独立预后因素是胶质瘤级别与1P/19q共缺失,PGM2表达在CGGA-325数据库中显示为独立预后因素(均 P< 0.05)。GO 富集分析和 KEGG 通路分析显示,PGM2表达与内质网蛋白转运、Toll 样受体信号通路以 及 I-κB 激酶 /NF-κB 信号通路相关。CIBERSORT 分析显示,PGM2低表达组与高表达组的初始 CD4+ T 细胞、活化的记忆 CD4+ T 细胞、调节性 T 细胞、单核细胞、巨噬细胞(M0、M1、M2)、中性粒细胞等的免疫 浸润程度比较,差异均有统计学意义(均P< 0.05)。结论 PGM2的高表达与胶质瘤较差的预后相关, 可能作为判断胶质瘤患者预后的指标,未来有望成为胶质瘤潜在的治疗靶点。

关 键 词:胶质瘤    PGM2    分子病理    预后

Expression and clinical significance of PGM2 in glioma
Shen Ruofei,Jiang Chuanlu,Cai Jinquan.Expression and clinical significance of PGM2 in glioma[J].Nervous Diseases and Mental Health,2024(5).
Authors:Shen Ruofei  Jiang Chuanlu  Cai Jinquan
Abstract:
Keywords:
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