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血清蛋白质指纹图谱结合生物信息学在大肠癌早期诊断中的应用
引用本文:陈益定,解磐磐,余建伟,周俊,郑树.血清蛋白质指纹图谱结合生物信息学在大肠癌早期诊断中的应用[J].浙江大学学报(医学版),2009,38(5).
作者姓名:陈益定  解磐磐  余建伟  周俊  郑树
作者单位:浙江大学医学院,附属第二医院肿瘤科,浙江,杭州,310009
基金项目:教育部霍英东优选资助基金,浙江省科技发展计划项目 
摘    要:目的:应用SELDI质谱仪建立大肠癌血清蛋白质指纹图谱的诊断模型.方法:测定182例血清标本(其中55例大肠癌、35例大肠腺瘤、92例健康人)的蛋白质指纹图谱,结合人工神经网络及支持向量机对这些数据进行处理,建立相应的指纹图谱诊断模型.结果:运用生物信息学方法从大肠癌与健康对照中筛选出了4个质荷比位于5 911 Da、8 922 Da、8 943 Da、8 817 Da(M/Z)峰,用它们建立的诊断模型的特异性为93.3%,敏感度为90.9%,Youden指数为0.84242.从大肠癌与大肠腺瘤中筛选出7个质荷比位于17 247 Da、18 420 Da、5 911 Da、9 294 Da、4 654 Da、21 694 Da、21 742 Da的峰值,建立模型的特异性为83.2%,敏感度为89.3%,Youden指数为0.72484.结论:该方法在大肠癌的诊断中较传统方法具有更高的敏感性和特异性.

关 键 词:结直肠肿瘤/诊断  肿瘤标记物  生物学/血液  表面加强解析/电离-飞行时间-质谱仪  神经网络(计算机)  诊断模型

Classification and diagnostic prediction of colorectal cancer using protein profiling of serum and bioinformatics
CHEN Yi-ding,XIE Pan-pan,YU Jian-wei,ZHOU Jun,ZHENG Shu.Classification and diagnostic prediction of colorectal cancer using protein profiling of serum and bioinformatics[J].Journal of Zhejiang University(Medical Sciences),2009,38(5).
Authors:CHEN Yi-ding  XIE Pan-pan  YU Jian-wei  ZHOU Jun  ZHENG Shu
Abstract:
Keywords:
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