基于RNA高通量测序研究右美托咪定对人神经母细胞瘤细胞基因表达的影响 |
| |
引用本文: | 管伟,白云峰,杜胜杰,王月兰,李希明.基于RNA高通量测序研究右美托咪定对人神经母细胞瘤细胞基因表达的影响[J].山东大学学报(医学版),2023(7):27-33. |
| |
作者姓名: | 管伟 白云峰 杜胜杰 王月兰 李希明 |
| |
作者单位: | 1. 临沂市人民医院麻醉科;2. 江苏省麻醉与镇痛重点实验室;3. 山东第一医科大学附属省立医院麻醉科 |
| |
摘 要: | 目的 分析右美托咪定对人神经母细胞瘤SH-SY5Y细胞表达谱差异的影响,探讨右美托咪定在脑保护中的潜在机制。方法 培养SH-SY5Y细胞,分为实验组(T组,生物学重复n=3)和对照组(C组,生物学重复n=3)。实验组用右美托咪定刺激48 h,对照组相同条件下用DMSO处理。使用Trizol提取RNA,在Illumina Novaseq平台进行RNA测序。采用Limma分析实验组与对照组的差异基因,并对差异基因进行基因本体(GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。结果 T组与C组相比,共有211个差异表达基因(上调105个,下调106个)。其中FGF1、GNG13、P2RY4在实验组和对照组中表达差异明显,差异倍数分别为2.23、2.00和6.56。GO富集分析示差异基因主要富集于磷脂酶C活化的G蛋白偶联受体信号通路、蛋白激酶B信号的调控、BMP信号通路。KEGG通路富集分析示差异基因主要富集于白细胞跨内皮迁移。结论 FGF1、GNG13、P2RY4等基因可能参与右美托咪定对脑的保护作用。右美托咪定可能主要通过炎症机制参与对中枢神经系统的保护。
|
关 键 词: | 右美托咪定 RNA高通量测序 SH-SY5Y细胞 脑保护 中枢神经系统 |
|
|