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基于RNA高通量测序研究右美托咪定对人神经母细胞瘤细胞基因表达的影响
引用本文:管伟,白云峰,杜胜杰,王月兰,李希明.基于RNA高通量测序研究右美托咪定对人神经母细胞瘤细胞基因表达的影响[J].山东大学学报(医学版),2023(7):27-33.
作者姓名:管伟  白云峰  杜胜杰  王月兰  李希明
作者单位:1. 临沂市人民医院麻醉科;2. 江苏省麻醉与镇痛重点实验室;3. 山东第一医科大学附属省立医院麻醉科
摘    要:目的 分析右美托咪定对人神经母细胞瘤SH-SY5Y细胞表达谱差异的影响,探讨右美托咪定在脑保护中的潜在机制。方法 培养SH-SY5Y细胞,分为实验组(T组,生物学重复n=3)和对照组(C组,生物学重复n=3)。实验组用右美托咪定刺激48 h,对照组相同条件下用DMSO处理。使用Trizol提取RNA,在Illumina Novaseq平台进行RNA测序。采用Limma分析实验组与对照组的差异基因,并对差异基因进行基因本体(GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。结果 T组与C组相比,共有211个差异表达基因(上调105个,下调106个)。其中FGF1、GNG13、P2RY4在实验组和对照组中表达差异明显,差异倍数分别为2.23、2.00和6.56。GO富集分析示差异基因主要富集于磷脂酶C活化的G蛋白偶联受体信号通路、蛋白激酶B信号的调控、BMP信号通路。KEGG通路富集分析示差异基因主要富集于白细胞跨内皮迁移。结论 FGF1、GNG13、P2RY4等基因可能参与右美托咪定对脑的保护作用。右美托咪定可能主要通过炎症机制参与对中枢神经系统的保护。

关 键 词:右美托咪定  RNA高通量测序  SH-SY5Y细胞  脑保护  中枢神经系统
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