肾透明细胞癌中预后相关RNA编辑位点的筛选 |
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引用本文: | 宋兆录,董正璇,彭传真,黄彩娜,胡克清,黄永胜,阎磊.肾透明细胞癌中预后相关RNA编辑位点的筛选[J].山东大学学报(医学版),2023(9):69-78. |
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作者姓名: | 宋兆录 董正璇 彭传真 黄彩娜 胡克清 黄永胜 阎磊 |
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作者单位: | 1. 青岛市胶州中心医院泌尿外科;2. 青岛市市立医院急诊科;3. 山东大学齐鲁医院泌尿外科 |
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基金项目: | 山东省重点研发计划(2019GSF108255); |
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摘 要: | 目的 探讨肾透明细胞癌(ccRCC)中与患者生存预后相关的RNA编辑位点。方法 下载癌症基因组图谱(TCGA)中RNA编辑位点的表达数据,使用最小绝对收缩和选择算子(LASSO)及Cox回归筛选出与ccRCC预后密切关联的RNA编辑位点。根据多因素Cox结果计算患者的风险评分后构建预后模型和列线图,进一步采用接受者操作特征(ROC)曲线评估预后模型和列线图的准确性,并进行相关的功能学分析。结果 共筛选出25个与ccRCC预后相关的RNA编辑位点。根据风险评分的中位值将患者分为高风险组(n=222)与低风险组(n=226)。Kaplan-Meier生存分析结果显示,高风险组患者的总生存时间与疾病无进展生存时间均低于低风险组(P<0.001)。预后模型和列线图预测患者1、3、5年生存的曲线下面积(AUC)值分别为0.801、0.824和0.806、0.858,0.833和0.821。风险分组之间具备不同的生物学功能及药物敏感性。结论 通过公共数据库筛选出的25个RNA编辑位点有望会成为ccRCC患者新的预后标记物。
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关 键 词: | 肾透明细胞癌 RNA编辑 预后模型 免疫治疗 |
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