分型引物RT-PCR法在杯状病毒分子流行病学研究中的应用

目的：应用分型引物RT-PCR法确定五个地区病毒性腹泻粪便标本中杯状病毒流行型别及感染情况。方法：对五个地区收集的〈5岁病毒性腹泻粪便标本应用针对病毒壳体区域设计的四对引物（GⅠ—SKF／GⅠ-SKR、COG2F／G2-SKR、SLV5317／SLV5749、PreCAP1／82b）进行反转录-聚合酶链反应（RT-PCR）扩增诺如病毒GⅠ和GⅡ组、扎如、星状病毒（Astrovirus），扩增产物通过1．5％琼脂糖凝胶电泳鉴定。选取部分阳性标本测序研究型别流行特点。结果：本实验从663例标本中共检出单独感染诺如病毒、扎如病毒和星状病毒阳性标本数分别为84、4、11株，同时还发现3株混合感染标本。选取24株诺如病毒阳性标本测序分析发现19株为GⅡ／4型，2株为GⅡ／3型，1株为GⅡ／1型，1株为GⅡ／13型，1株为GⅡ／15型，4株扎如病毒中2株为SGⅠ／1型，1株为SGⅡ／3型，1株为SGⅡ／1型。结论：研究表明杯状病毒是我国婴幼儿腹泻重要病原体，诺如病毒流行株为GⅡ／4型毒株，同时存在其它型别的散在流行；福建、兰州检测到不同型别扎如病毒证明我国存在多种型别的扎如病毒感染。