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| 铁皮石斛谷氨酸脱羧酶基因的分离与生物信息学分析 | |
| 引用本文： | 张岗,胡本祥,李依民,张大为,郭顺星. 铁皮石斛谷氨酸脱羧酶基因的分离与生物信息学分析[J]. 中国医药生物技术, 2014, 9(5): 328-334 |
| 作者姓名： | 张岗 胡本祥 李依民 张大为 郭顺星 |
| 作者单位： | 1. 712046 西安，陕西中医学院药学院/陕西省中药基础与新药研究重点实验室; 100193 北京，中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所 2. 陕西中医学院药学院/陕西省中药基础与新药研究重点实验室, 西安,712046 3. 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所, 北京,100193 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金(31070300、31101608)；陕西省青年科技新星项目(2012KJXX-44)；陕西省教育厅专项科研计划项目 |
| 摘 要： | 目的分离珍稀濒危兰科药用铁皮石斛谷氨酸脱羧酶（GAD）基因并进行生物信息学和表达分析。方法采用 RT-PCR和 RACE技术获基因 cDNA全长；利用生物信息学软件分析蛋白理化性质、结构域和三维建模等分子特性；用 DNASTAR 6.0和 MEGA 4.0分别进行氨基酸多序列比对和进化树分析；借助实时定量 PCR检测基因表达。结果分离到DoGAD基因，cDNA全长1795 bp，编码一条由498个氨基酸组成的多肽，分子量55.90 kD，等电点5.32；DoGAD蛋白不含跨膜域或信号肽，具有谷氨酸脱羧酶和磷酸吡哆醛依赖的脱羧酶结构域（17-443、37-381）；DoGAD与植物 GADs蛋白一致性为69.5%~78.8%，隶属于 GADs分子进化树的植物类群；DoGAD转录本在石斛叶和茎中相对表达量较高，分别为根中的5.16和3.92倍。结论成功克隆得到铁皮石斛谷氨酸脱羧酶基因全长， DoGAD 的表达特征暗示其可能在铁皮石斛叶和茎中发挥重要的调控作用。 |
| 关 键 词： | 铁皮石斛 谷氨酸脱羧酶 γ-氨基丁酸 计算生物学 基因克隆 |
Isolation and bioinformatics analysis of a glutamate decarboxylase gene inDendrobium officinale |
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| ZHANG Gang,HU Ben-xiang,LI Yi-min,ZHANG Da-wei,GUO Shun-xing. Isolation and bioinformatics analysis of a glutamate decarboxylase gene inDendrobium officinale[J]. Chinese Medicinal Biotechnology, 2014, 9(5): 328-334 | |
| Authors: | ZHANG Gang HU Ben-xiang LI Yi-min ZHANG Da-wei GUO Shun-xing |
| Affiliation: | ZHANG Gang;HU Ben-xiang;LI Yi-min;ZHANG Da-wei;GUO Shun-xing;College of Pharmacy and Shanxi Provincial Key Laboratory for Chinese Medicine Basis & New Drugs Research,Shanxi University of Chinese Medicine;Institute of Medicinal Plant Development,Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College; |
| Abstract: | |
| Keywords: | Dendrobium officinale Glutamate decarboxylase Gamma-aminobutyric acid Compatational biology Gene clone |
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