| 乳腺癌MDA-MB-231细胞中Rab7a基因的网络分析 |
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| 引用本文： | 徐凤英,刘儒,马丽,曲一帆,肖伟利,王玉珍,谢基明.乳腺癌MDA-MB-231细胞中Rab7a基因的网络分析[J].吉林大学学报(医学版),2020,46(3):464-469. |
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| 作者姓名： | 徐凤英 刘儒 马丽 曲一帆 肖伟利 王玉珍 谢基明 |
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| 作者单位： | 1. 内蒙古医科大学研究生学院, 内蒙古 呼和浩特 010110;2. 内蒙古自治区人民医院检验科, 内蒙古 呼和浩特 010010;3. 内蒙古农业大学生命科学学院, 内蒙古 呼和浩特 010018 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助课题（81360394，31270922） |
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| 摘 要： | 目的：探讨三阴性乳腺癌（TNBC） MDA-MB-231细胞中Rab7a基因敲除后相关基因表达的变化，阐明Rab7a相关基因在TNBC中的作用。方法：选取对数生长期的乳腺癌ZR-75-30、MCF-7、T-47D、MDA-MB-231和HCC-1937细胞，采用Western blotting法检测乳腺癌ZR-75-30、MCF-7、T-47D、MDA-MB-231和HCC-1937细胞中Rab7a蛋白表达水平。慢病毒敲除TNBCMDA-MB-231细胞中Rab7a基因，分为阴性对照组和Rab7a基因敲除组，根据敲除的4种不同Rab7a序列分为KD1组、KD2组、KD3组和KD4组。采用qPCR法检测各组MDA-MB-231细胞中Rab7a基因敲除效率，全基因表达谱芯片检测Rab7a基因敲除效率最高组（KD2组）和阴性对照组差异基因，一体化通路分析（IPA）软件分析Rab7a基因与其他基因的相互作用。结果：在TNBCMDA-MB-231细胞中可见Rab7a蛋白表达。与阴性对照组比较，KD2组乳腺癌MDA-MB-231细胞中Rab7a基因敲除效率最高（P<0.01）；与阴性对照组比较，KD2组乳腺癌MDA-MB-231细胞中有634个差异基因，其中上调基因和下调基因数均增多（P<0.01）；差异基因分析，Rab7a基因敲除与癌症、细胞存活、细胞周期和细胞生长及转移等有密切联系；Rab7a的IPA网络图中eIF4F、IRS1和RPS6KB1表达下调，PRKAA1、IKBKE、VEGFA和转录因子ATF2表达上调。结论：Rab7a基因在TNBCMDA-MB-231细胞中以基因网络的形式发挥作用；Rab7a基因与多基因相互作用，参与癌细胞的病理过程。
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| 关 键 词： | 乳腺肿瘤 Rab7a 三阴性乳腺癌 MDA-MB-231细胞 一体化通路分析 |
| 收稿时间： | 2019-06-04 |
Network analysis on Rab7a gene in breast cancer MDA-MB-231 cells |
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| XU Fengying,LIU Ru,MA Li,QU Yifan,XIAO Weili,WANG Yuzhen,XIE Jiming.Network analysis on Rab7a gene in breast cancer MDA-MB-231 cells[J].Journal of Jilin University: Med Ed,2020,46(3):464-469. |
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| Authors: | XU Fengying LIU Ru MA Li QU Yifan XIAO Weili WANG Yuzhen XIE Jiming |
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| Institution: | 1. Graduate School, Inner Mongolia Medical University, Hohhot 010110, China;2. Department of Clinical Laboratory, People's Hospital, Inner Mongolia Autonomons Region, Hohhot 010010, China;3. College of Life Science, Inner Mongolia Agricultural University, Hohhot 010018, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | breast neplasom Rab7a triple-negative breast cancer MDA-MB-231 cells Ingenuity Pathway Analysis |
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