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基于生物信息学分析NEIL3在肝细胞癌中的表达及其临床意义
引用本文:张建国,何亮,王久阳,姜涛.基于生物信息学分析NEIL3在肝细胞癌中的表达及其临床意义[J].东南大学学报(医学版),2022(3):386-393.
作者姓名:张建国  何亮  王久阳  姜涛
作者单位:1. 北京市平谷区医院普外科;2. 北京市平谷区医院病理科
摘    要:目的:基于生物信息学分析Nei核酸内切酶Ⅷ样3(Nei endonucleaseⅧ-like 3, NEIL3)在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)中的表达和临床意义。方法:利用TCGA数据库的mRNA数据和临床数据分析NEIL3在肝细胞癌中的表达和临床意义。使用GEPIA和Kaplan-Meier数据库分析NEIL3表达对HCC患者预后的影响。使用UALCAN和cBioPortal数据库分析NEIL3在HCC中的甲基化水平。使用STRING、Metascape和LinkedOmics探索NEIL3在HCC中的潜在作用机制。结果:与正常组相比,NEIL3在HCC显著高表达。临床相关性分析结果显示,NEIL3表达与患者的病理分期及肿瘤大小呈负相关。Kaplan-Meier生存曲线显示,NEIL3高表达与HCC患者较差的总体生存期、无病生存期、无进展生存期、无复发生存期有关。表观遗传学研究发现,NEIL3基因的低甲基化可能是NEIL3在HCC中表达上调的原因之一。功能富集分析发现,NEIL3可能通过参与细胞周期、DNA复制、同源重组、错配修复、p53信号...

关 键 词:肝细胞癌  Nei核酸内切酶Ⅷ样3  生物信息学
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