基于网络药理学与分子对接挖掘地锦草抗类风湿关节炎的作用机制※ |
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作者姓名: | 刘守才 廖承谱 赵小超 商勋 丁美婷 吴玲 |
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作者单位: | 江苏省宿迁市中医院(江苏 宿迁 223800),湖北省通城县公共检验检测中心(湖北 咸宁 437000),江苏省宿迁市中医院(江苏 宿迁 223800),江苏省宿迁市中医院(江苏 宿迁 223800),江苏省宿迁市中医院(江苏 宿迁 223800),江苏省宿迁市中医院(江苏 宿迁 223800) |
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基金项目: | ※基金项目 宿迁市科技局自然科学基金青年科技人才项目(No.k202011) |
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摘 要: | 目的 通过网络药理学和分子对接实验挖掘地锦草对类风湿关节炎的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中药分子作用机制的生物信息学分析工具(Batman-TCM)、基因组注释数据库(GeneCard)、人类孟德尔遗传数据库(OMIM)以及文献检索获取地锦草的活性成分、作用靶点、类风湿关节炎相关靶点,String数据库构建蛋白互作网络,Cytoscape 3.8.0构建成分-靶点-疾病网络,Bioconductor进行GO功能富集和KEGG通路分析,AutoDockVina分子对接验证。结果 共获得15个主要活性成分和38个关键靶点。GO功能富集分析得到53个分子功能条目,主要涉及DNA结合转录因子结合、核糖核酸聚合酶II特异性脱氧核糖核酸结合转录因子结合受体配体活性、泛素蛋白连接酶结合、泛素样蛋白连接酶结合、核受体活性;KEGG 通路富集分析得到 89条信号通路,主要包含脂质与动脉粥样硬化、流体切应力与动脉粥样硬化、肿瘤坏死因子信号通路、细胞凋亡、化学致癌-受体激活、白细胞介素-17信号通路等;分子对接验证发现槲皮素、山奈酚、4'',5-二羟基黄酮与关键抗类风湿关节炎靶点蛋白结合较好,4'',5-二羟基黄酮与AR靶点形成最佳结合。结论 地锦草主要通过PTGS1、AR、DPP4、HSP90AA1、RELA等靶基因对炎症因子、细胞凋亡及相关功能进行调节而发挥治疗类风湿关节炎的作用。
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关 键 词: | 地锦草 类风湿关节炎 分子机制 网络药理学 分子对接 |
收稿时间: | 2022-04-24 |
修稿时间: | 2023-01-03 |
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