牙周炎与急性心肌梗死串扰基因的生物信息学分析

目的 基于生物信息学方式探究牙周炎与急性心肌梗死之间潜在的串扰基因、共享的信号通路，揭示两疾病之间潜在的病理生理学关系。方法 从GEO数据库中下载牙周炎基因芯片数据集GSE16134与急性心肌梗死基因芯片数据集GSE66360，利用limma包筛选出两疾病的差异表达基因，取交集后获得串扰基因。对串扰基因进行基因本体论和京都基因与基因组百科全书富集分析；通过STRING数据库建立串扰基因的蛋白质互作网络，利用Cytoscape软件中的Cytohubba插件筛选关键基因（hub基因）；绘制受试者工作特征曲线，检验hub基因诊断价值。结果 筛选出41个串扰基因，主要富集在对细菌源分子的反应，对脂多糖的反应，中性粒细胞迁移等生物学功能，以及脂质与动脉粥样硬化，NF-κB，百日咳等信号通路；PPI网络中筛选了10个相互作用程度较高的hub基因，分别为：IL-1β,CXCL8,FCGR3B,PECAM1,MMP9,CD14,CXCL1,HCK,LYN,CSF2RB。其中IL-1β与CXCL8在两疾病中均具有良好的诊断价值。结论 IL-1β与CXCL8是牙周炎与心肌梗死之间重要的串扰基因，可能在牙周...