| GEO芯片联合网络药理学和分子对接探讨归芍地黄汤治疗新生血管性年龄相关性黄斑变性的作用机制及实验验证 |
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| 引用本文： | 石楠楠,曹明芳,李婧,梁慧颖,吴安迪,袁智.GEO芯片联合网络药理学和分子对接探讨归芍地黄汤治疗新生血管性年龄相关性黄斑变性的作用机制及实验验证[J].现代药物与临床,2023,38(6):1321-1334. |
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| 作者姓名： | 石楠楠 曹明芳 李婧 梁慧颖 吴安迪 袁智 |
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| 作者单位： | 福建中医药大学,福建 福州 350122;福建中医药大学附属人民医院,福建 福州 350122 |
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| 基金项目： | 福建省自然科学基金资助项目(2020J011046);福建中医药大学附属人民医院中药制剂研发项目(ZYZJ2019003) |
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| 摘 要： | 目的 基于高通量基因表达数据库（GEO）、网络药理学和分子对接技术分析归芍地黄汤对新生血管性年龄相关性黄斑变性的可能作用靶点和相关机制，并通过体内实验进行验证。方法 通过查阅文献及中国传统医学公共数据库（TCMSP）确定归芍地黄汤的主要成分及靶标，绘制成分–靶点网络拓扑图。通过整合GEO数据库和公共数据库对新生血管性年龄相关性黄斑变性的疾病靶点进行预测。使用Venny在线平台确定药物–疾病的交集靶点，构建蛋白质相互作用（PPI）网络图，利用Cytoscape软件筛选关键基因（Hub），利用R语言对交集靶点进行基因本体（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析。将归芍地黄汤核心成分与靶基因之间进行分子对接，最后利用光学相干断层扫描和免疫组化显示组织病理学变化，荧光素眼底血管造影观察脉络膜新生血管膜渗漏情况，并验证其对靶基因表达水平的影响。结果 从GSE29801数据集中获得50个差异基因，筛选得到药物–疾病交集靶点134个。核心靶点包括白蛋白（ALB）、肿瘤蛋白p53(TP53)、蛋白激酶B1(Akt1)、白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子（TNF）、半胱氨酸天冬氨酸蛋...
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| 关 键 词： | 归芍地黄汤 新生血管性年龄相关性黄斑变性 GEO数据库 网络药理学 山柰酚 槲皮素 |
| 收稿时间： | 2023/2/13 0:00:00 |
Mechanism and verification of Guishao Dihuang Decoction in treatment of neovascular age related macular degeneration by GEO gene microarray combined with network pharmacology and molecular docking technology |
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| SHI Nan-nan,CAO Ming-fang,LI Jing,LIANG Hui-ying,WU An-di,YUAN Zhi.Mechanism and verification of Guishao Dihuang Decoction in treatment of neovascular age related macular degeneration by GEO gene microarray combined with network pharmacology and molecular docking technology[J].Drugs & Clinic,2023,38(6):1321-1334. |
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| Authors: | SHI Nan-nan CAO Ming-fang LI Jing LIANG Hui-ying WU An-di YUAN Zhi |
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| Institution: | Fujian University of Traditional Chinese Medicine, Fuzhou 350122, China;People''s Hospital Affiliated to Fujian University of Traditional Chinese Medicine, Fuzhou 350004, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | GuiShaoDiHuang Decoction neovascular age-related macular degeneration GEO gene microarray database network pharmacology kaempferol quercetin |
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